Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLK3P07288 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLK3P07288 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLK3P07288 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLK3P07288 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLK3P07288 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLK3P07288 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLK3P07288 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLK3P07288 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLK3P07288 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLK3P07288 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLK3P07288 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLK3P07288 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLK3P07288 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLK3P07288 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLK3P07288 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLK3P07288 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLK3P07288 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLK3P07288 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLK3P07288 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLK3P07288 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLK3P07288 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLK3P07288 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLK3P07288 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLK3P07288 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLK3P07288 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLK3P07288 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLK3P07288 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLK3P07288 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLK3P07288 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLK3P07288 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLK3P07288 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLK3P07288 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLK3P07288 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLK3P07288 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLK3P07288 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLK3P07288 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLK3P07288 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLK3P07288 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLK3P07288 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLK3P07288 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLK3P07288 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLK3P07288 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLK3P07288 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLK3P07288 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLK3P07288 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLK3P07288 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLK3P07288 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLK3P07288 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLK3P07288 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLK3P07288 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLK3P07288 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLK3P07288 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLK3P07288 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLK3P07288 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLK3P07288 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLK3P07288 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLK3P07288 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLK3P07288 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLK3P07288 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLK3P07288 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLK3P07288 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLK3P07288 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLK3P07288 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLK3P07288 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KLK3P07288 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLK3P07288 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLK3P07288 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLK3P07288 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLK3P07288 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLK3P07288 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLK3P07288 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLK3P07288 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLK3P07288 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLK3P07288 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLK3P07288 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLK3P07288 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLK3P07288 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLK3P07288 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLK3P07288 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KLK3P07288 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLK3P07288 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLK3P07288 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KLK3P07288 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLK3P07288 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLK3P07288 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLK3P07288 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KLK3P07288 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLK3P07288 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLK3P07288 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLK3P07288 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLK3P07288 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLK3P07288 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLK3P07288 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLK3P07288 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLK3P07288 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLK3P07288 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLK3P07288 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
KLK3P07288 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLK3P07288 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms