Protein–RNA interactions for Protein: O95409

ZIC2, Zinc finger protein ZIC 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC2O95409 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC2O95409 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms