Protein–RNA interactions for Protein: O95149

SNUPN, Snurportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNUPNO95149 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNUPNO95149 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNUPNO95149 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNUPNO95149 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNUPNO95149 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNUPNO95149 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNUPNO95149 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNUPNO95149 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNUPNO95149 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNUPNO95149 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNUPNO95149 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNUPNO95149 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNUPNO95149 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNUPNO95149 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNUPNO95149 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNUPNO95149 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNUPNO95149 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNUPNO95149 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNUPNO95149 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNUPNO95149 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNUPNO95149 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNUPNO95149 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNUPNO95149 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNUPNO95149 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNUPNO95149 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNUPNO95149 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNUPNO95149 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNUPNO95149 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNUPNO95149 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNUPNO95149 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNUPNO95149 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNUPNO95149 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNUPNO95149 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNUPNO95149 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNUPNO95149 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNUPNO95149 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNUPNO95149 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNUPNO95149 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNUPNO95149 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNUPNO95149 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms