Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRAMEF10O60809 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms