Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COCHO43405 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COCHO43405 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COCHO43405 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COCHO43405 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COCHO43405 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COCHO43405 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COCHO43405 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COCHO43405 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COCHO43405 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COCHO43405 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
COCHO43405 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COCHO43405 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COCHO43405 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COCHO43405 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COCHO43405 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COCHO43405 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COCHO43405 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COCHO43405 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
COCHO43405 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COCHO43405 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
COCHO43405 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COCHO43405 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COCHO43405 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COCHO43405 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
COCHO43405 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
COCHO43405 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
COCHO43405 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
COCHO43405 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COCHO43405 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
COCHO43405 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COCHO43405 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COCHO43405 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COCHO43405 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COCHO43405 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COCHO43405 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COCHO43405 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COCHO43405 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COCHO43405 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COCHO43405 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COCHO43405 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COCHO43405 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COCHO43405 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COCHO43405 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COCHO43405 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COCHO43405 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COCHO43405 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COCHO43405 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COCHO43405 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COCHO43405 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COCHO43405 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COCHO43405 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COCHO43405 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COCHO43405 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COCHO43405 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COCHO43405 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COCHO43405 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COCHO43405 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COCHO43405 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COCHO43405 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COCHO43405 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COCHO43405 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COCHO43405 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COCHO43405 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COCHO43405 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COCHO43405 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COCHO43405 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
COCHO43405 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COCHO43405 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COCHO43405 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COCHO43405 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
COCHO43405 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COCHO43405 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COCHO43405 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COCHO43405 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COCHO43405 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COCHO43405 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COCHO43405 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COCHO43405 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
COCHO43405 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COCHO43405 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COCHO43405 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COCHO43405 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COCHO43405 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COCHO43405 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COCHO43405 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COCHO43405 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COCHO43405 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COCHO43405 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COCHO43405 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
COCHO43405 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COCHO43405 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COCHO43405 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COCHO43405 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COCHO43405 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COCHO43405 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COCHO43405 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COCHO43405 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COCHO43405 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COCHO43405 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms