Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms