Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DXG7 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DXG7 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DXG7 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DXG7 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DXG7 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DXG7 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DXG7 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DXG7 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DXG7 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DXG7 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DXG7 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DXG7 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DXG7 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DXG7 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DXG7 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DXG7 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DXG7 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DXG7 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DXG7 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
B4DXG7 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
B4DXG7 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
B4DXG7 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
B4DXG7 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
B4DXG7 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
B4DXG7 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
B4DXG7 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
B4DXG7 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DXG7 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
B4DXG7 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
B4DXG7 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DXG7 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
B4DXG7 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
B4DXG7 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DXG7 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
B4DXG7 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DXG7 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.08■□□□□ 0
B4DXG7 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DXG7 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DXG7 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.08■□□□□ 0
B4DXG7 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
B4DXG7 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DXG7 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
B4DXG7 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
B4DXG7 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DXG7 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
B4DXG7 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
B4DXG7 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
B4DXG7 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.08■□□□□ 0
B4DXG7 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.08■□□□□ 0
B4DXG7 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
B4DXG7 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
B4DXG7 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.08■□□□□ 0
B4DXG7 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
B4DXG7 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DXG7 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
B4DXG7 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
B4DXG7 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DXG7 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
B4DXG7 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
B4DXG7 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DXG7 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DXG7 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DXG7 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
B4DXG7 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DXG7 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DXG7 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
B4DXG7 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
B4DXG7 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DXG7 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DXG7 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4DXG7 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DXG7 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
B4DXG7 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DXG7 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
B4DXG7 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
B4DXG7 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DXG7 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
B4DXG7 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
B4DXG7 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DXG7 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DXG7 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DXG7 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DXG7 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DXG7 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
B4DXG7 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DXG7 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
B4DXG7 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DXG7 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DXG7 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DXG7 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DXG7 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.07■□□□□ 0
B4DXG7 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.07■□□□□ 0
B4DXG7 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
B4DXG7 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
B4DXG7 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
B4DXG7 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.07■□□□□ 0
B4DXG7 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
B4DXG7 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DXG7 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms