Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMGB1P1B2RPK0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms