Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3R4

NEU2, Sialidase-2, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU2Q9Y3R4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEU2Q9Y3R4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEU2Q9Y3R4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEU2Q9Y3R4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEU2Q9Y3R4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEU2Q9Y3R4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEU2Q9Y3R4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NEU2Q9Y3R4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEU2Q9Y3R4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEU2Q9Y3R4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEU2Q9Y3R4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEU2Q9Y3R4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEU2Q9Y3R4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEU2Q9Y3R4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEU2Q9Y3R4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEU2Q9Y3R4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEU2Q9Y3R4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEU2Q9Y3R4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEU2Q9Y3R4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEU2Q9Y3R4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEU2Q9Y3R4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEU2Q9Y3R4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEU2Q9Y3R4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEU2Q9Y3R4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEU2Q9Y3R4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEU2Q9Y3R4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEU2Q9Y3R4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEU2Q9Y3R4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEU2Q9Y3R4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEU2Q9Y3R4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEU2Q9Y3R4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEU2Q9Y3R4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEU2Q9Y3R4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEU2Q9Y3R4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEU2Q9Y3R4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEU2Q9Y3R4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEU2Q9Y3R4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEU2Q9Y3R4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEU2Q9Y3R4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEU2Q9Y3R4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEU2Q9Y3R4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEU2Q9Y3R4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEU2Q9Y3R4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEU2Q9Y3R4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEU2Q9Y3R4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEU2Q9Y3R4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEU2Q9Y3R4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEU2Q9Y3R4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEU2Q9Y3R4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEU2Q9Y3R4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEU2Q9Y3R4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEU2Q9Y3R4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEU2Q9Y3R4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEU2Q9Y3R4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEU2Q9Y3R4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEU2Q9Y3R4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEU2Q9Y3R4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEU2Q9Y3R4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEU2Q9Y3R4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEU2Q9Y3R4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEU2Q9Y3R4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NEU2Q9Y3R4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEU2Q9Y3R4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEU2Q9Y3R4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEU2Q9Y3R4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEU2Q9Y3R4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEU2Q9Y3R4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEU2Q9Y3R4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEU2Q9Y3R4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEU2Q9Y3R4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NEU2Q9Y3R4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEU2Q9Y3R4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEU2Q9Y3R4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEU2Q9Y3R4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEU2Q9Y3R4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEU2Q9Y3R4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEU2Q9Y3R4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEU2Q9Y3R4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEU2Q9Y3R4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NEU2Q9Y3R4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEU2Q9Y3R4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEU2Q9Y3R4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEU2Q9Y3R4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEU2Q9Y3R4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEU2Q9Y3R4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEU2Q9Y3R4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NEU2Q9Y3R4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEU2Q9Y3R4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEU2Q9Y3R4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEU2Q9Y3R4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEU2Q9Y3R4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEU2Q9Y3R4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEU2Q9Y3R4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEU2Q9Y3R4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEU2Q9Y3R4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEU2Q9Y3R4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEU2Q9Y3R4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEU2Q9Y3R4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEU2Q9Y3R4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEU2Q9Y3R4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms