Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B8

REXO2, Oligoribonuclease, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO2Q9Y3B8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
REXO2Q9Y3B8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
REXO2Q9Y3B8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
REXO2Q9Y3B8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
REXO2Q9Y3B8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
REXO2Q9Y3B8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
REXO2Q9Y3B8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
REXO2Q9Y3B8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
REXO2Q9Y3B8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
REXO2Q9Y3B8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
REXO2Q9Y3B8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
REXO2Q9Y3B8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
REXO2Q9Y3B8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
REXO2Q9Y3B8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
REXO2Q9Y3B8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
REXO2Q9Y3B8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
REXO2Q9Y3B8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
REXO2Q9Y3B8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
REXO2Q9Y3B8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
REXO2Q9Y3B8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
REXO2Q9Y3B8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
REXO2Q9Y3B8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
REXO2Q9Y3B8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
REXO2Q9Y3B8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
REXO2Q9Y3B8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
REXO2Q9Y3B8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
REXO2Q9Y3B8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
REXO2Q9Y3B8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
REXO2Q9Y3B8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
REXO2Q9Y3B8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
REXO2Q9Y3B8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
REXO2Q9Y3B8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
REXO2Q9Y3B8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
REXO2Q9Y3B8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
REXO2Q9Y3B8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
REXO2Q9Y3B8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
REXO2Q9Y3B8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
REXO2Q9Y3B8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
REXO2Q9Y3B8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
REXO2Q9Y3B8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
REXO2Q9Y3B8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
REXO2Q9Y3B8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
REXO2Q9Y3B8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
REXO2Q9Y3B8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
REXO2Q9Y3B8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
REXO2Q9Y3B8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
REXO2Q9Y3B8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
REXO2Q9Y3B8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
REXO2Q9Y3B8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
REXO2Q9Y3B8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
REXO2Q9Y3B8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
REXO2Q9Y3B8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
REXO2Q9Y3B8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
REXO2Q9Y3B8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
REXO2Q9Y3B8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
REXO2Q9Y3B8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
REXO2Q9Y3B8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
REXO2Q9Y3B8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
REXO2Q9Y3B8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
REXO2Q9Y3B8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
REXO2Q9Y3B8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
REXO2Q9Y3B8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
REXO2Q9Y3B8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
REXO2Q9Y3B8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
REXO2Q9Y3B8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
REXO2Q9Y3B8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
REXO2Q9Y3B8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
REXO2Q9Y3B8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
REXO2Q9Y3B8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
REXO2Q9Y3B8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
REXO2Q9Y3B8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
REXO2Q9Y3B8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
REXO2Q9Y3B8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
REXO2Q9Y3B8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
REXO2Q9Y3B8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
REXO2Q9Y3B8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
REXO2Q9Y3B8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
REXO2Q9Y3B8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
REXO2Q9Y3B8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
REXO2Q9Y3B8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
REXO2Q9Y3B8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
REXO2Q9Y3B8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
REXO2Q9Y3B8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
REXO2Q9Y3B8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
REXO2Q9Y3B8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
REXO2Q9Y3B8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
REXO2Q9Y3B8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
REXO2Q9Y3B8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
REXO2Q9Y3B8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
REXO2Q9Y3B8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
REXO2Q9Y3B8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
REXO2Q9Y3B8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
REXO2Q9Y3B8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
REXO2Q9Y3B8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
REXO2Q9Y3B8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
REXO2Q9Y3B8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
REXO2Q9Y3B8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
REXO2Q9Y3B8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
REXO2Q9Y3B8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
REXO2Q9Y3B8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms