Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TMED7Q9Y3B3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMED7Q9Y3B3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMED7Q9Y3B3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMED7Q9Y3B3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TMED7Q9Y3B3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMED7Q9Y3B3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMED7Q9Y3B3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMED7Q9Y3B3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMED7Q9Y3B3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMED7Q9Y3B3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMED7Q9Y3B3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMED7Q9Y3B3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMED7Q9Y3B3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMED7Q9Y3B3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMED7Q9Y3B3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMED7Q9Y3B3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMED7Q9Y3B3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMED7Q9Y3B3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMED7Q9Y3B3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMED7Q9Y3B3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMED7Q9Y3B3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMED7Q9Y3B3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMED7Q9Y3B3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TMED7Q9Y3B3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMED7Q9Y3B3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMED7Q9Y3B3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMED7Q9Y3B3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMED7Q9Y3B3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMED7Q9Y3B3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMED7Q9Y3B3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMED7Q9Y3B3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMED7Q9Y3B3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMED7Q9Y3B3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMED7Q9Y3B3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMED7Q9Y3B3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMED7Q9Y3B3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMED7Q9Y3B3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMED7Q9Y3B3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TMED7Q9Y3B3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TMED7Q9Y3B3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMED7Q9Y3B3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMED7Q9Y3B3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMED7Q9Y3B3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMED7Q9Y3B3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMED7Q9Y3B3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMED7Q9Y3B3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMED7Q9Y3B3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMED7Q9Y3B3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMED7Q9Y3B3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMED7Q9Y3B3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMED7Q9Y3B3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMED7Q9Y3B3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMED7Q9Y3B3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMED7Q9Y3B3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TMED7Q9Y3B3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMED7Q9Y3B3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMED7Q9Y3B3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMED7Q9Y3B3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMED7Q9Y3B3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMED7Q9Y3B3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMED7Q9Y3B3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMED7Q9Y3B3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMED7Q9Y3B3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMED7Q9Y3B3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMED7Q9Y3B3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMED7Q9Y3B3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMED7Q9Y3B3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMED7Q9Y3B3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMED7Q9Y3B3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMED7Q9Y3B3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMED7Q9Y3B3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TMED7Q9Y3B3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMED7Q9Y3B3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TMED7Q9Y3B3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMED7Q9Y3B3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMED7Q9Y3B3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TMED7Q9Y3B3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMED7Q9Y3B3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TMED7Q9Y3B3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMED7Q9Y3B3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMED7Q9Y3B3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMED7Q9Y3B3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMED7Q9Y3B3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TMED7Q9Y3B3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMED7Q9Y3B3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMED7Q9Y3B3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMED7Q9Y3B3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMED7Q9Y3B3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMED7Q9Y3B3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMED7Q9Y3B3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMED7Q9Y3B3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TMED7Q9Y3B3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMED7Q9Y3B3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMED7Q9Y3B3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TMED7Q9Y3B3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMED7Q9Y3B3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMED7Q9Y3B3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMED7Q9Y3B3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMED7Q9Y3B3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms