Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K2

SIK3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK3Q9Y2K2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIK3Q9Y2K2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIK3Q9Y2K2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIK3Q9Y2K2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIK3Q9Y2K2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIK3Q9Y2K2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIK3Q9Y2K2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIK3Q9Y2K2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIK3Q9Y2K2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIK3Q9Y2K2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIK3Q9Y2K2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIK3Q9Y2K2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIK3Q9Y2K2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIK3Q9Y2K2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIK3Q9Y2K2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIK3Q9Y2K2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIK3Q9Y2K2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIK3Q9Y2K2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SIK3Q9Y2K2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SIK3Q9Y2K2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIK3Q9Y2K2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIK3Q9Y2K2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIK3Q9Y2K2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIK3Q9Y2K2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIK3Q9Y2K2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIK3Q9Y2K2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIK3Q9Y2K2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIK3Q9Y2K2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIK3Q9Y2K2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIK3Q9Y2K2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIK3Q9Y2K2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SIK3Q9Y2K2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SIK3Q9Y2K2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIK3Q9Y2K2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIK3Q9Y2K2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIK3Q9Y2K2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIK3Q9Y2K2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIK3Q9Y2K2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIK3Q9Y2K2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIK3Q9Y2K2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIK3Q9Y2K2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIK3Q9Y2K2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIK3Q9Y2K2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIK3Q9Y2K2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIK3Q9Y2K2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIK3Q9Y2K2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIK3Q9Y2K2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIK3Q9Y2K2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIK3Q9Y2K2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIK3Q9Y2K2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIK3Q9Y2K2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SIK3Q9Y2K2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIK3Q9Y2K2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIK3Q9Y2K2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIK3Q9Y2K2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIK3Q9Y2K2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIK3Q9Y2K2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIK3Q9Y2K2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIK3Q9Y2K2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIK3Q9Y2K2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIK3Q9Y2K2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIK3Q9Y2K2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIK3Q9Y2K2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIK3Q9Y2K2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIK3Q9Y2K2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIK3Q9Y2K2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIK3Q9Y2K2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIK3Q9Y2K2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIK3Q9Y2K2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIK3Q9Y2K2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIK3Q9Y2K2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIK3Q9Y2K2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIK3Q9Y2K2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIK3Q9Y2K2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIK3Q9Y2K2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIK3Q9Y2K2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIK3Q9Y2K2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIK3Q9Y2K2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIK3Q9Y2K2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIK3Q9Y2K2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SIK3Q9Y2K2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIK3Q9Y2K2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIK3Q9Y2K2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIK3Q9Y2K2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIK3Q9Y2K2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIK3Q9Y2K2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIK3Q9Y2K2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIK3Q9Y2K2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIK3Q9Y2K2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIK3Q9Y2K2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIK3Q9Y2K2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIK3Q9Y2K2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIK3Q9Y2K2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIK3Q9Y2K2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIK3Q9Y2K2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIK3Q9Y2K2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SIK3Q9Y2K2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SIK3Q9Y2K2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIK3Q9Y2K2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIK3Q9Y2K2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms