Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y277

VDAC3, Voltage-dependent anion-selective channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDAC3Q9Y277 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VDAC3Q9Y277 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
VDAC3Q9Y277 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VDAC3Q9Y277 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VDAC3Q9Y277 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VDAC3Q9Y277 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VDAC3Q9Y277 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VDAC3Q9Y277 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VDAC3Q9Y277 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VDAC3Q9Y277 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VDAC3Q9Y277 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VDAC3Q9Y277 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VDAC3Q9Y277 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VDAC3Q9Y277 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VDAC3Q9Y277 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VDAC3Q9Y277 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VDAC3Q9Y277 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VDAC3Q9Y277 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VDAC3Q9Y277 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VDAC3Q9Y277 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VDAC3Q9Y277 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VDAC3Q9Y277 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
VDAC3Q9Y277 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VDAC3Q9Y277 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VDAC3Q9Y277 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VDAC3Q9Y277 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VDAC3Q9Y277 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VDAC3Q9Y277 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VDAC3Q9Y277 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VDAC3Q9Y277 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VDAC3Q9Y277 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VDAC3Q9Y277 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VDAC3Q9Y277 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VDAC3Q9Y277 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VDAC3Q9Y277 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VDAC3Q9Y277 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
VDAC3Q9Y277 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VDAC3Q9Y277 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VDAC3Q9Y277 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms