Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RCE1Q9Y256 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RCE1Q9Y256 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RCE1Q9Y256 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RCE1Q9Y256 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RCE1Q9Y256 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RCE1Q9Y256 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RCE1Q9Y256 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RCE1Q9Y256 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RCE1Q9Y256 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RCE1Q9Y256 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RCE1Q9Y256 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RCE1Q9Y256 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RCE1Q9Y256 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RCE1Q9Y256 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RCE1Q9Y256 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RCE1Q9Y256 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RCE1Q9Y256 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RCE1Q9Y256 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RCE1Q9Y256 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RCE1Q9Y256 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RCE1Q9Y256 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RCE1Q9Y256 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RCE1Q9Y256 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RCE1Q9Y256 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RCE1Q9Y256 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RCE1Q9Y256 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RCE1Q9Y256 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RCE1Q9Y256 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RCE1Q9Y256 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RCE1Q9Y256 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RCE1Q9Y256 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RCE1Q9Y256 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RCE1Q9Y256 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RCE1Q9Y256 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RCE1Q9Y256 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RCE1Q9Y256 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RCE1Q9Y256 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RCE1Q9Y256 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms