Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQQ2

SH2B3, SH2B adapter protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B3Q9UQQ2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2B3Q9UQQ2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2B3Q9UQQ2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2B3Q9UQQ2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH2B3Q9UQQ2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH2B3Q9UQQ2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH2B3Q9UQQ2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH2B3Q9UQQ2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SH2B3Q9UQQ2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2B3Q9UQQ2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2B3Q9UQQ2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2B3Q9UQQ2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2B3Q9UQQ2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2B3Q9UQQ2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2B3Q9UQQ2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2B3Q9UQQ2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2B3Q9UQQ2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2B3Q9UQQ2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2B3Q9UQQ2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2B3Q9UQQ2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2B3Q9UQQ2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2B3Q9UQQ2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2B3Q9UQQ2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2B3Q9UQQ2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH2B3Q9UQQ2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH2B3Q9UQQ2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH2B3Q9UQQ2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH2B3Q9UQQ2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH2B3Q9UQQ2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH2B3Q9UQQ2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SH2B3Q9UQQ2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2B3Q9UQQ2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2B3Q9UQQ2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2B3Q9UQQ2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2B3Q9UQQ2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2B3Q9UQQ2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2B3Q9UQQ2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2B3Q9UQQ2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2B3Q9UQQ2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2B3Q9UQQ2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2B3Q9UQQ2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2B3Q9UQQ2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2B3Q9UQQ2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2B3Q9UQQ2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2B3Q9UQQ2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2B3Q9UQQ2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2B3Q9UQQ2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2B3Q9UQQ2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2B3Q9UQQ2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2B3Q9UQQ2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SH2B3Q9UQQ2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH2B3Q9UQQ2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH2B3Q9UQQ2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH2B3Q9UQQ2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH2B3Q9UQQ2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH2B3Q9UQQ2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH2B3Q9UQQ2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2B3Q9UQQ2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2B3Q9UQQ2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2B3Q9UQQ2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2B3Q9UQQ2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2B3Q9UQQ2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2B3Q9UQQ2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2B3Q9UQQ2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2B3Q9UQQ2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2B3Q9UQQ2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2B3Q9UQQ2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2B3Q9UQQ2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2B3Q9UQQ2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2B3Q9UQQ2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2B3Q9UQQ2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2B3Q9UQQ2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2B3Q9UQQ2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2B3Q9UQQ2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2B3Q9UQQ2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2B3Q9UQQ2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2B3Q9UQQ2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2B3Q9UQQ2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2B3Q9UQQ2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2B3Q9UQQ2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2B3Q9UQQ2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2B3Q9UQQ2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2B3Q9UQQ2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2B3Q9UQQ2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2B3Q9UQQ2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2B3Q9UQQ2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2B3Q9UQQ2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2B3Q9UQQ2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2B3Q9UQQ2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2B3Q9UQQ2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2B3Q9UQQ2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2B3Q9UQQ2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2B3Q9UQQ2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2B3Q9UQQ2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2B3Q9UQQ2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2B3Q9UQQ2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2B3Q9UQQ2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2B3Q9UQQ2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2B3Q9UQQ2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH2B3Q9UQQ2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms