Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ52

CNTN6, Contactin-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN6Q9UQ52 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTN6Q9UQ52 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTN6Q9UQ52 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTN6Q9UQ52 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTN6Q9UQ52 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTN6Q9UQ52 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTN6Q9UQ52 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTN6Q9UQ52 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTN6Q9UQ52 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTN6Q9UQ52 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTN6Q9UQ52 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTN6Q9UQ52 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTN6Q9UQ52 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTN6Q9UQ52 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTN6Q9UQ52 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTN6Q9UQ52 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTN6Q9UQ52 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTN6Q9UQ52 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTN6Q9UQ52 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTN6Q9UQ52 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTN6Q9UQ52 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTN6Q9UQ52 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTN6Q9UQ52 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTN6Q9UQ52 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTN6Q9UQ52 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTN6Q9UQ52 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTN6Q9UQ52 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTN6Q9UQ52 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTN6Q9UQ52 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTN6Q9UQ52 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTN6Q9UQ52 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTN6Q9UQ52 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTN6Q9UQ52 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTN6Q9UQ52 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTN6Q9UQ52 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTN6Q9UQ52 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTN6Q9UQ52 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNTN6Q9UQ52 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNTN6Q9UQ52 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNTN6Q9UQ52 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNTN6Q9UQ52 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNTN6Q9UQ52 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNTN6Q9UQ52 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTN6Q9UQ52 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTN6Q9UQ52 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTN6Q9UQ52 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTN6Q9UQ52 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTN6Q9UQ52 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTN6Q9UQ52 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTN6Q9UQ52 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTN6Q9UQ52 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTN6Q9UQ52 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTN6Q9UQ52 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTN6Q9UQ52 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTN6Q9UQ52 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTN6Q9UQ52 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTN6Q9UQ52 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTN6Q9UQ52 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTN6Q9UQ52 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTN6Q9UQ52 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTN6Q9UQ52 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTN6Q9UQ52 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTN6Q9UQ52 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTN6Q9UQ52 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTN6Q9UQ52 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTN6Q9UQ52 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTN6Q9UQ52 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTN6Q9UQ52 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTN6Q9UQ52 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTN6Q9UQ52 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTN6Q9UQ52 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTN6Q9UQ52 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTN6Q9UQ52 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTN6Q9UQ52 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTN6Q9UQ52 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTN6Q9UQ52 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTN6Q9UQ52 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTN6Q9UQ52 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTN6Q9UQ52 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTN6Q9UQ52 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTN6Q9UQ52 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTN6Q9UQ52 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTN6Q9UQ52 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTN6Q9UQ52 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTN6Q9UQ52 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTN6Q9UQ52 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTN6Q9UQ52 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTN6Q9UQ52 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CNTN6Q9UQ52 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTN6Q9UQ52 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTN6Q9UQ52 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTN6Q9UQ52 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTN6Q9UQ52 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTN6Q9UQ52 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTN6Q9UQ52 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTN6Q9UQ52 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTN6Q9UQ52 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTN6Q9UQ52 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTN6Q9UQ52 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTN6Q9UQ52 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms