Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AGTPBP1Q9UPW5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
AGTPBP1Q9UPW5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AGTPBP1Q9UPW5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
AGTPBP1Q9UPW5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
AGTPBP1Q9UPW5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
AGTPBP1Q9UPW5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AGTPBP1Q9UPW5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
AGTPBP1Q9UPW5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
AGTPBP1Q9UPW5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.56■■■□□ 2
AGTPBP1Q9UPW5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
AGTPBP1Q9UPW5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
AGTPBP1Q9UPW5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
AGTPBP1Q9UPW5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
AGTPBP1Q9UPW5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
AGTPBP1Q9UPW5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
AGTPBP1Q9UPW5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
AGTPBP1Q9UPW5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
AGTPBP1Q9UPW5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
AGTPBP1Q9UPW5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AGTPBP1Q9UPW5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AGTPBP1Q9UPW5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
AGTPBP1Q9UPW5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
AGTPBP1Q9UPW5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
AGTPBP1Q9UPW5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.53■■■□□ 2
AGTPBP1Q9UPW5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
AGTPBP1Q9UPW5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AGTPBP1Q9UPW5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AGTPBP1Q9UPW5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AGTPBP1Q9UPW5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.52■■■□□ 2
AGTPBP1Q9UPW5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
AGTPBP1Q9UPW5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
AGTPBP1Q9UPW5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
AGTPBP1Q9UPW5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
AGTPBP1Q9UPW5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
AGTPBP1Q9UPW5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
AGTPBP1Q9UPW5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
AGTPBP1Q9UPW5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AGTPBP1Q9UPW5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
AGTPBP1Q9UPW5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
AGTPBP1Q9UPW5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
AGTPBP1Q9UPW5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AGTPBP1Q9UPW5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AGTPBP1Q9UPW5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AGTPBP1Q9UPW5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AGTPBP1Q9UPW5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
AGTPBP1Q9UPW5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AGTPBP1Q9UPW5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
AGTPBP1Q9UPW5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
AGTPBP1Q9UPW5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
AGTPBP1Q9UPW5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
AGTPBP1Q9UPW5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
AGTPBP1Q9UPW5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AGTPBP1Q9UPW5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AGTPBP1Q9UPW5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
AGTPBP1Q9UPW5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AGTPBP1Q9UPW5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
AGTPBP1Q9UPW5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AGTPBP1Q9UPW5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AGTPBP1Q9UPW5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
AGTPBP1Q9UPW5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AGTPBP1Q9UPW5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AGTPBP1Q9UPW5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AGTPBP1Q9UPW5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
AGTPBP1Q9UPW5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AGTPBP1Q9UPW5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AGTPBP1Q9UPW5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AGTPBP1Q9UPW5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
AGTPBP1Q9UPW5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
AGTPBP1Q9UPW5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
AGTPBP1Q9UPW5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
AGTPBP1Q9UPW5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
AGTPBP1Q9UPW5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
AGTPBP1Q9UPW5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
AGTPBP1Q9UPW5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
AGTPBP1Q9UPW5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
AGTPBP1Q9UPW5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
AGTPBP1Q9UPW5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AGTPBP1Q9UPW5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
AGTPBP1Q9UPW5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
AGTPBP1Q9UPW5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AGTPBP1Q9UPW5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
AGTPBP1Q9UPW5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
AGTPBP1Q9UPW5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
AGTPBP1Q9UPW5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AGTPBP1Q9UPW5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
AGTPBP1Q9UPW5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AGTPBP1Q9UPW5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
AGTPBP1Q9UPW5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AGTPBP1Q9UPW5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
AGTPBP1Q9UPW5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AGTPBP1Q9UPW5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
AGTPBP1Q9UPW5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
AGTPBP1Q9UPW5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
AGTPBP1Q9UPW5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
AGTPBP1Q9UPW5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms