Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP52

TFR2, Transferrin receptor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFR2Q9UP52 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TFR2Q9UP52 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFR2Q9UP52 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFR2Q9UP52 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFR2Q9UP52 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFR2Q9UP52 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFR2Q9UP52 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFR2Q9UP52 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFR2Q9UP52 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFR2Q9UP52 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFR2Q9UP52 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFR2Q9UP52 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFR2Q9UP52 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFR2Q9UP52 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFR2Q9UP52 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFR2Q9UP52 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFR2Q9UP52 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFR2Q9UP52 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFR2Q9UP52 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFR2Q9UP52 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFR2Q9UP52 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFR2Q9UP52 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFR2Q9UP52 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFR2Q9UP52 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFR2Q9UP52 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFR2Q9UP52 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFR2Q9UP52 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFR2Q9UP52 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFR2Q9UP52 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFR2Q9UP52 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFR2Q9UP52 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFR2Q9UP52 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFR2Q9UP52 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFR2Q9UP52 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFR2Q9UP52 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFR2Q9UP52 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFR2Q9UP52 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TFR2Q9UP52 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFR2Q9UP52 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFR2Q9UP52 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFR2Q9UP52 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFR2Q9UP52 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFR2Q9UP52 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFR2Q9UP52 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFR2Q9UP52 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFR2Q9UP52 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFR2Q9UP52 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFR2Q9UP52 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFR2Q9UP52 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFR2Q9UP52 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFR2Q9UP52 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFR2Q9UP52 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFR2Q9UP52 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFR2Q9UP52 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFR2Q9UP52 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFR2Q9UP52 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TFR2Q9UP52 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFR2Q9UP52 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFR2Q9UP52 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFR2Q9UP52 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TFR2Q9UP52 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFR2Q9UP52 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFR2Q9UP52 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFR2Q9UP52 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TFR2Q9UP52 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFR2Q9UP52 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFR2Q9UP52 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFR2Q9UP52 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFR2Q9UP52 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFR2Q9UP52 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFR2Q9UP52 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFR2Q9UP52 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFR2Q9UP52 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFR2Q9UP52 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFR2Q9UP52 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFR2Q9UP52 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFR2Q9UP52 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFR2Q9UP52 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFR2Q9UP52 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFR2Q9UP52 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFR2Q9UP52 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFR2Q9UP52 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFR2Q9UP52 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFR2Q9UP52 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFR2Q9UP52 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFR2Q9UP52 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFR2Q9UP52 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TFR2Q9UP52 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TFR2Q9UP52 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TFR2Q9UP52 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TFR2Q9UP52 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TFR2Q9UP52 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TFR2Q9UP52 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TFR2Q9UP52 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TFR2Q9UP52 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TFR2Q9UP52 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TFR2Q9UP52 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TFR2Q9UP52 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TFR2Q9UP52 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TFR2Q9UP52 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms