Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ2

SYNRG, Synergin gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNRGQ9UMZ2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNRGQ9UMZ2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNRGQ9UMZ2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNRGQ9UMZ2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNRGQ9UMZ2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYNRGQ9UMZ2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYNRGQ9UMZ2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYNRGQ9UMZ2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYNRGQ9UMZ2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYNRGQ9UMZ2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYNRGQ9UMZ2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYNRGQ9UMZ2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYNRGQ9UMZ2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNRGQ9UMZ2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNRGQ9UMZ2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNRGQ9UMZ2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNRGQ9UMZ2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNRGQ9UMZ2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNRGQ9UMZ2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNRGQ9UMZ2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNRGQ9UMZ2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNRGQ9UMZ2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNRGQ9UMZ2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNRGQ9UMZ2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNRGQ9UMZ2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNRGQ9UMZ2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SYNRGQ9UMZ2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SYNRGQ9UMZ2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SYNRGQ9UMZ2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
SYNRGQ9UMZ2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
SYNRGQ9UMZ2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SYNRGQ9UMZ2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYNRGQ9UMZ2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SYNRGQ9UMZ2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNRGQ9UMZ2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNRGQ9UMZ2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNRGQ9UMZ2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNRGQ9UMZ2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNRGQ9UMZ2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNRGQ9UMZ2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNRGQ9UMZ2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNRGQ9UMZ2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNRGQ9UMZ2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNRGQ9UMZ2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNRGQ9UMZ2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNRGQ9UMZ2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNRGQ9UMZ2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNRGQ9UMZ2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNRGQ9UMZ2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNRGQ9UMZ2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNRGQ9UMZ2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNRGQ9UMZ2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNRGQ9UMZ2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNRGQ9UMZ2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNRGQ9UMZ2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNRGQ9UMZ2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNRGQ9UMZ2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNRGQ9UMZ2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNRGQ9UMZ2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNRGQ9UMZ2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNRGQ9UMZ2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNRGQ9UMZ2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNRGQ9UMZ2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNRGQ9UMZ2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNRGQ9UMZ2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNRGQ9UMZ2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNRGQ9UMZ2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNRGQ9UMZ2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNRGQ9UMZ2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYNRGQ9UMZ2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYNRGQ9UMZ2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SYNRGQ9UMZ2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SYNRGQ9UMZ2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SYNRGQ9UMZ2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYNRGQ9UMZ2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SYNRGQ9UMZ2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYNRGQ9UMZ2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYNRGQ9UMZ2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYNRGQ9UMZ2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYNRGQ9UMZ2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYNRGQ9UMZ2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYNRGQ9UMZ2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYNRGQ9UMZ2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYNRGQ9UMZ2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SYNRGQ9UMZ2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYNRGQ9UMZ2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYNRGQ9UMZ2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNRGQ9UMZ2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNRGQ9UMZ2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNRGQ9UMZ2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNRGQ9UMZ2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNRGQ9UMZ2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNRGQ9UMZ2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNRGQ9UMZ2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNRGQ9UMZ2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNRGQ9UMZ2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNRGQ9UMZ2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNRGQ9UMZ2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNRGQ9UMZ2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNRGQ9UMZ2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms