Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS5

PHTF1, Putative homeodomain transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF1Q9UMS5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PHTF1Q9UMS5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHTF1Q9UMS5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHTF1Q9UMS5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHTF1Q9UMS5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHTF1Q9UMS5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHTF1Q9UMS5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHTF1Q9UMS5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHTF1Q9UMS5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHTF1Q9UMS5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHTF1Q9UMS5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHTF1Q9UMS5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHTF1Q9UMS5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHTF1Q9UMS5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHTF1Q9UMS5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHTF1Q9UMS5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHTF1Q9UMS5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHTF1Q9UMS5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHTF1Q9UMS5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHTF1Q9UMS5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHTF1Q9UMS5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHTF1Q9UMS5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHTF1Q9UMS5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHTF1Q9UMS5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHTF1Q9UMS5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHTF1Q9UMS5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHTF1Q9UMS5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHTF1Q9UMS5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHTF1Q9UMS5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHTF1Q9UMS5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHTF1Q9UMS5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHTF1Q9UMS5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PHTF1Q9UMS5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHTF1Q9UMS5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHTF1Q9UMS5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHTF1Q9UMS5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHTF1Q9UMS5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHTF1Q9UMS5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHTF1Q9UMS5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHTF1Q9UMS5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHTF1Q9UMS5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136 ms