Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM19

HPCAL4, Hippocalcin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL4Q9UM19 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HPCAL4Q9UM19 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HPCAL4Q9UM19 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HPCAL4Q9UM19 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HPCAL4Q9UM19 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HPCAL4Q9UM19 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HPCAL4Q9UM19 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HPCAL4Q9UM19 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HPCAL4Q9UM19 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HPCAL4Q9UM19 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HPCAL4Q9UM19 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HPCAL4Q9UM19 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HPCAL4Q9UM19 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HPCAL4Q9UM19 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HPCAL4Q9UM19 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HPCAL4Q9UM19 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HPCAL4Q9UM19 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HPCAL4Q9UM19 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HPCAL4Q9UM19 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HPCAL4Q9UM19 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HPCAL4Q9UM19 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HPCAL4Q9UM19 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HPCAL4Q9UM19 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HPCAL4Q9UM19 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HPCAL4Q9UM19 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HPCAL4Q9UM19 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HPCAL4Q9UM19 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HPCAL4Q9UM19 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HPCAL4Q9UM19 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HPCAL4Q9UM19 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HPCAL4Q9UM19 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HPCAL4Q9UM19 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HPCAL4Q9UM19 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HPCAL4Q9UM19 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HPCAL4Q9UM19 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HPCAL4Q9UM19 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HPCAL4Q9UM19 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HPCAL4Q9UM19 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HPCAL4Q9UM19 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HPCAL4Q9UM19 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HPCAL4Q9UM19 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HPCAL4Q9UM19 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HPCAL4Q9UM19 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HPCAL4Q9UM19 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HPCAL4Q9UM19 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
HPCAL4Q9UM19 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HPCAL4Q9UM19 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HPCAL4Q9UM19 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HPCAL4Q9UM19 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HPCAL4Q9UM19 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HPCAL4Q9UM19 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HPCAL4Q9UM19 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HPCAL4Q9UM19 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HPCAL4Q9UM19 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HPCAL4Q9UM19 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HPCAL4Q9UM19 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HPCAL4Q9UM19 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HPCAL4Q9UM19 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HPCAL4Q9UM19 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HPCAL4Q9UM19 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HPCAL4Q9UM19 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HPCAL4Q9UM19 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HPCAL4Q9UM19 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HPCAL4Q9UM19 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HPCAL4Q9UM19 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HPCAL4Q9UM19 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HPCAL4Q9UM19 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HPCAL4Q9UM19 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HPCAL4Q9UM19 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HPCAL4Q9UM19 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HPCAL4Q9UM19 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HPCAL4Q9UM19 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HPCAL4Q9UM19 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HPCAL4Q9UM19 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HPCAL4Q9UM19 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HPCAL4Q9UM19 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HPCAL4Q9UM19 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HPCAL4Q9UM19 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPCAL4Q9UM19 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPCAL4Q9UM19 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPCAL4Q9UM19 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPCAL4Q9UM19 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPCAL4Q9UM19 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HPCAL4Q9UM19 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HPCAL4Q9UM19 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPCAL4Q9UM19 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPCAL4Q9UM19 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPCAL4Q9UM19 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPCAL4Q9UM19 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPCAL4Q9UM19 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPCAL4Q9UM19 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HPCAL4Q9UM19 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPCAL4Q9UM19 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPCAL4Q9UM19 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPCAL4Q9UM19 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPCAL4Q9UM19 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HPCAL4Q9UM19 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HPCAL4Q9UM19 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HPCAL4Q9UM19 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HPCAL4Q9UM19 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms