Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNRF3Q9ULT6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNRF3Q9ULT6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNRF3Q9ULT6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNRF3Q9ULT6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNRF3Q9ULT6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNRF3Q9ULT6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNRF3Q9ULT6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNRF3Q9ULT6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNRF3Q9ULT6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNRF3Q9ULT6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNRF3Q9ULT6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNRF3Q9ULT6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNRF3Q9ULT6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNRF3Q9ULT6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNRF3Q9ULT6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNRF3Q9ULT6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNRF3Q9ULT6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNRF3Q9ULT6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNRF3Q9ULT6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNRF3Q9ULT6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNRF3Q9ULT6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNRF3Q9ULT6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNRF3Q9ULT6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNRF3Q9ULT6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZNRF3Q9ULT6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZNRF3Q9ULT6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZNRF3Q9ULT6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZNRF3Q9ULT6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ZNRF3Q9ULT6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZNRF3Q9ULT6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZNRF3Q9ULT6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNRF3Q9ULT6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNRF3Q9ULT6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNRF3Q9ULT6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNRF3Q9ULT6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNRF3Q9ULT6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNRF3Q9ULT6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZNRF3Q9ULT6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNRF3Q9ULT6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNRF3Q9ULT6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNRF3Q9ULT6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNRF3Q9ULT6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNRF3Q9ULT6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNRF3Q9ULT6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNRF3Q9ULT6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNRF3Q9ULT6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNRF3Q9ULT6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNRF3Q9ULT6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNRF3Q9ULT6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNRF3Q9ULT6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNRF3Q9ULT6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNRF3Q9ULT6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNRF3Q9ULT6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNRF3Q9ULT6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNRF3Q9ULT6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNRF3Q9ULT6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNRF3Q9ULT6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNRF3Q9ULT6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNRF3Q9ULT6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNRF3Q9ULT6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNRF3Q9ULT6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNRF3Q9ULT6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNRF3Q9ULT6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNRF3Q9ULT6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNRF3Q9ULT6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNRF3Q9ULT6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNRF3Q9ULT6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNRF3Q9ULT6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZNRF3Q9ULT6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZNRF3Q9ULT6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZNRF3Q9ULT6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZNRF3Q9ULT6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZNRF3Q9ULT6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
ZNRF3Q9ULT6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZNRF3Q9ULT6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZNRF3Q9ULT6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNRF3Q9ULT6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNRF3Q9ULT6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNRF3Q9ULT6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNRF3Q9ULT6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNRF3Q9ULT6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ZNRF3Q9ULT6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZNRF3Q9ULT6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZNRF3Q9ULT6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZNRF3Q9ULT6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
ZNRF3Q9ULT6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
ZNRF3Q9ULT6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZNRF3Q9ULT6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZNRF3Q9ULT6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZNRF3Q9ULT6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNRF3Q9ULT6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNRF3Q9ULT6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZNRF3Q9ULT6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZNRF3Q9ULT6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZNRF3Q9ULT6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZNRF3Q9ULT6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZNRF3Q9ULT6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ZNRF3Q9ULT6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.9 ms