Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKW4

VAV3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, humanhuman

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV3Q9UKW4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VAV3Q9UKW4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VAV3Q9UKW4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VAV3Q9UKW4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VAV3Q9UKW4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VAV3Q9UKW4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VAV3Q9UKW4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VAV3Q9UKW4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VAV3Q9UKW4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VAV3Q9UKW4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VAV3Q9UKW4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VAV3Q9UKW4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VAV3Q9UKW4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VAV3Q9UKW4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
VAV3Q9UKW4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VAV3Q9UKW4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VAV3Q9UKW4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VAV3Q9UKW4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VAV3Q9UKW4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VAV3Q9UKW4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VAV3Q9UKW4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VAV3Q9UKW4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VAV3Q9UKW4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VAV3Q9UKW4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VAV3Q9UKW4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VAV3Q9UKW4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VAV3Q9UKW4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VAV3Q9UKW4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VAV3Q9UKW4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VAV3Q9UKW4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VAV3Q9UKW4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VAV3Q9UKW4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VAV3Q9UKW4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VAV3Q9UKW4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VAV3Q9UKW4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VAV3Q9UKW4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VAV3Q9UKW4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VAV3Q9UKW4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VAV3Q9UKW4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VAV3Q9UKW4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VAV3Q9UKW4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VAV3Q9UKW4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VAV3Q9UKW4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VAV3Q9UKW4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VAV3Q9UKW4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VAV3Q9UKW4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VAV3Q9UKW4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VAV3Q9UKW4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VAV3Q9UKW4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VAV3Q9UKW4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VAV3Q9UKW4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VAV3Q9UKW4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VAV3Q9UKW4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VAV3Q9UKW4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VAV3Q9UKW4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VAV3Q9UKW4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
VAV3Q9UKW4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VAV3Q9UKW4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VAV3Q9UKW4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VAV3Q9UKW4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VAV3Q9UKW4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VAV3Q9UKW4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VAV3Q9UKW4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
VAV3Q9UKW4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VAV3Q9UKW4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VAV3Q9UKW4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VAV3Q9UKW4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VAV3Q9UKW4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
VAV3Q9UKW4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VAV3Q9UKW4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VAV3Q9UKW4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VAV3Q9UKW4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VAV3Q9UKW4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VAV3Q9UKW4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VAV3Q9UKW4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
VAV3Q9UKW4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VAV3Q9UKW4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VAV3Q9UKW4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VAV3Q9UKW4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VAV3Q9UKW4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VAV3Q9UKW4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VAV3Q9UKW4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VAV3Q9UKW4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VAV3Q9UKW4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VAV3Q9UKW4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VAV3Q9UKW4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VAV3Q9UKW4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VAV3Q9UKW4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VAV3Q9UKW4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VAV3Q9UKW4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VAV3Q9UKW4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VAV3Q9UKW4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
VAV3Q9UKW4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VAV3Q9UKW4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
VAV3Q9UKW4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
VAV3Q9UKW4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VAV3Q9UKW4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VAV3Q9UKW4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VAV3Q9UKW4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VAV3Q9UKW4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms