Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN5

PRDM4, PR domain zinc finger protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4Q9UKN5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDM4Q9UKN5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDM4Q9UKN5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDM4Q9UKN5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRDM4Q9UKN5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRDM4Q9UKN5 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRDM4Q9UKN5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRDM4Q9UKN5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM4Q9UKN5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM4Q9UKN5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM4Q9UKN5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM4Q9UKN5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM4Q9UKN5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM4Q9UKN5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM4Q9UKN5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM4Q9UKN5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM4Q9UKN5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM4Q9UKN5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM4Q9UKN5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM4Q9UKN5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM4Q9UKN5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM4Q9UKN5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM4Q9UKN5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM4Q9UKN5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM4Q9UKN5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM4Q9UKN5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM4Q9UKN5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM4Q9UKN5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM4Q9UKN5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM4Q9UKN5 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM4Q9UKN5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM4Q9UKN5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM4Q9UKN5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM4Q9UKN5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM4Q9UKN5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM4Q9UKN5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM4Q9UKN5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM4Q9UKN5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM4Q9UKN5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM4Q9UKN5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM4Q9UKN5 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM4Q9UKN5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM4Q9UKN5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM4Q9UKN5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM4Q9UKN5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM4Q9UKN5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM4Q9UKN5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM4Q9UKN5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM4Q9UKN5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM4Q9UKN5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM4Q9UKN5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM4Q9UKN5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM4Q9UKN5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM4Q9UKN5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM4Q9UKN5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM4Q9UKN5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM4Q9UKN5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM4Q9UKN5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM4Q9UKN5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM4Q9UKN5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM4Q9UKN5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM4Q9UKN5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM4Q9UKN5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM4Q9UKN5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM4Q9UKN5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM4Q9UKN5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM4Q9UKN5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM4Q9UKN5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM4Q9UKN5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM4Q9UKN5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM4Q9UKN5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM4Q9UKN5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM4Q9UKN5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM4Q9UKN5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM4Q9UKN5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM4Q9UKN5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM4Q9UKN5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM4Q9UKN5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM4Q9UKN5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM4Q9UKN5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM4Q9UKN5 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM4Q9UKN5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM4Q9UKN5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM4Q9UKN5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM4Q9UKN5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM4Q9UKN5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM4Q9UKN5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDM4Q9UKN5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDM4Q9UKN5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDM4Q9UKN5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM4Q9UKN5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM4Q9UKN5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM4Q9UKN5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM4Q9UKN5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM4Q9UKN5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM4Q9UKN5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM4Q9UKN5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM4Q9UKN5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM4Q9UKN5 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM4Q9UKN5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms