Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMS3Q9UJD0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMS3Q9UJD0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMS3Q9UJD0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMS3Q9UJD0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMS3Q9UJD0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMS3Q9UJD0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMS3Q9UJD0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMS3Q9UJD0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMS3Q9UJD0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIMS3Q9UJD0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIMS3Q9UJD0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIMS3Q9UJD0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RIMS3Q9UJD0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIMS3Q9UJD0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIMS3Q9UJD0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RIMS3Q9UJD0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIMS3Q9UJD0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIMS3Q9UJD0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIMS3Q9UJD0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RIMS3Q9UJD0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIMS3Q9UJD0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIMS3Q9UJD0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIMS3Q9UJD0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIMS3Q9UJD0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIMS3Q9UJD0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIMS3Q9UJD0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIMS3Q9UJD0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIMS3Q9UJD0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIMS3Q9UJD0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIMS3Q9UJD0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RIMS3Q9UJD0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIMS3Q9UJD0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIMS3Q9UJD0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIMS3Q9UJD0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RIMS3Q9UJD0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RIMS3Q9UJD0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RIMS3Q9UJD0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RIMS3Q9UJD0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIMS3Q9UJD0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIMS3Q9UJD0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIMS3Q9UJD0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIMS3Q9UJD0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIMS3Q9UJD0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIMS3Q9UJD0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIMS3Q9UJD0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIMS3Q9UJD0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIMS3Q9UJD0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIMS3Q9UJD0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIMS3Q9UJD0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIMS3Q9UJD0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIMS3Q9UJD0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIMS3Q9UJD0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIMS3Q9UJD0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIMS3Q9UJD0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIMS3Q9UJD0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIMS3Q9UJD0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIMS3Q9UJD0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIMS3Q9UJD0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RIMS3Q9UJD0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIMS3Q9UJD0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RIMS3Q9UJD0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIMS3Q9UJD0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIMS3Q9UJD0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIMS3Q9UJD0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIMS3Q9UJD0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIMS3Q9UJD0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIMS3Q9UJD0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIMS3Q9UJD0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIMS3Q9UJD0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIMS3Q9UJD0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIMS3Q9UJD0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIMS3Q9UJD0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIMS3Q9UJD0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIMS3Q9UJD0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIMS3Q9UJD0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIMS3Q9UJD0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIMS3Q9UJD0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIMS3Q9UJD0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIMS3Q9UJD0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIMS3Q9UJD0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIMS3Q9UJD0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIMS3Q9UJD0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIMS3Q9UJD0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIMS3Q9UJD0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIMS3Q9UJD0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIMS3Q9UJD0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
RIMS3Q9UJD0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIMS3Q9UJD0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIMS3Q9UJD0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIMS3Q9UJD0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIMS3Q9UJD0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIMS3Q9UJD0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIMS3Q9UJD0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIMS3Q9UJD0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIMS3Q9UJD0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIMS3Q9UJD0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIMS3Q9UJD0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIMS3Q9UJD0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIMS3Q9UJD0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms