Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJA2

CRLS1, Cardiolipin synthase (CMP-forming), humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRLS1Q9UJA2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CRLS1Q9UJA2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRLS1Q9UJA2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRLS1Q9UJA2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRLS1Q9UJA2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRLS1Q9UJA2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRLS1Q9UJA2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRLS1Q9UJA2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRLS1Q9UJA2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRLS1Q9UJA2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRLS1Q9UJA2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRLS1Q9UJA2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRLS1Q9UJA2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CRLS1Q9UJA2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRLS1Q9UJA2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRLS1Q9UJA2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRLS1Q9UJA2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRLS1Q9UJA2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRLS1Q9UJA2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRLS1Q9UJA2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRLS1Q9UJA2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRLS1Q9UJA2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRLS1Q9UJA2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRLS1Q9UJA2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRLS1Q9UJA2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRLS1Q9UJA2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRLS1Q9UJA2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRLS1Q9UJA2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CRLS1Q9UJA2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRLS1Q9UJA2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRLS1Q9UJA2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CRLS1Q9UJA2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CRLS1Q9UJA2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CRLS1Q9UJA2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CRLS1Q9UJA2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRLS1Q9UJA2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRLS1Q9UJA2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRLS1Q9UJA2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRLS1Q9UJA2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms