Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHM6

OPN4, Melanopsin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN4Q9UHM6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
OPN4Q9UHM6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
OPN4Q9UHM6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OPN4Q9UHM6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
OPN4Q9UHM6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
OPN4Q9UHM6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
OPN4Q9UHM6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
OPN4Q9UHM6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OPN4Q9UHM6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
OPN4Q9UHM6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
OPN4Q9UHM6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
OPN4Q9UHM6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
OPN4Q9UHM6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OPN4Q9UHM6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OPN4Q9UHM6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
OPN4Q9UHM6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
OPN4Q9UHM6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
OPN4Q9UHM6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
OPN4Q9UHM6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
OPN4Q9UHM6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
OPN4Q9UHM6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
OPN4Q9UHM6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
OPN4Q9UHM6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
OPN4Q9UHM6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
OPN4Q9UHM6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
OPN4Q9UHM6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
OPN4Q9UHM6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OPN4Q9UHM6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
OPN4Q9UHM6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
OPN4Q9UHM6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
OPN4Q9UHM6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OPN4Q9UHM6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
OPN4Q9UHM6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
OPN4Q9UHM6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
OPN4Q9UHM6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
OPN4Q9UHM6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
OPN4Q9UHM6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
OPN4Q9UHM6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
OPN4Q9UHM6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
OPN4Q9UHM6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
OPN4Q9UHM6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
OPN4Q9UHM6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
OPN4Q9UHM6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
OPN4Q9UHM6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
OPN4Q9UHM6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
OPN4Q9UHM6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
OPN4Q9UHM6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
OPN4Q9UHM6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
OPN4Q9UHM6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
OPN4Q9UHM6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
OPN4Q9UHM6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
OPN4Q9UHM6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
OPN4Q9UHM6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
OPN4Q9UHM6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
OPN4Q9UHM6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
OPN4Q9UHM6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
OPN4Q9UHM6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
OPN4Q9UHM6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
OPN4Q9UHM6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
OPN4Q9UHM6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
OPN4Q9UHM6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
OPN4Q9UHM6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
OPN4Q9UHM6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
OPN4Q9UHM6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
OPN4Q9UHM6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
OPN4Q9UHM6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms