Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC3

ASIC3, Acid-sensing ion channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC3Q9UHC3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ASIC3Q9UHC3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ASIC3Q9UHC3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ASIC3Q9UHC3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ASIC3Q9UHC3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ASIC3Q9UHC3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ASIC3Q9UHC3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ASIC3Q9UHC3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ASIC3Q9UHC3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ASIC3Q9UHC3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ASIC3Q9UHC3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ASIC3Q9UHC3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ASIC3Q9UHC3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ASIC3Q9UHC3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ASIC3Q9UHC3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ASIC3Q9UHC3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ASIC3Q9UHC3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ASIC3Q9UHC3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASIC3Q9UHC3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASIC3Q9UHC3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASIC3Q9UHC3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASIC3Q9UHC3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASIC3Q9UHC3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASIC3Q9UHC3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASIC3Q9UHC3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASIC3Q9UHC3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASIC3Q9UHC3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASIC3Q9UHC3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASIC3Q9UHC3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASIC3Q9UHC3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ASIC3Q9UHC3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASIC3Q9UHC3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASIC3Q9UHC3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASIC3Q9UHC3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASIC3Q9UHC3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASIC3Q9UHC3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASIC3Q9UHC3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASIC3Q9UHC3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASIC3Q9UHC3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASIC3Q9UHC3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASIC3Q9UHC3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASIC3Q9UHC3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASIC3Q9UHC3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASIC3Q9UHC3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASIC3Q9UHC3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASIC3Q9UHC3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASIC3Q9UHC3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASIC3Q9UHC3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASIC3Q9UHC3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASIC3Q9UHC3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ASIC3Q9UHC3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASIC3Q9UHC3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASIC3Q9UHC3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASIC3Q9UHC3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 492.9 ms