Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB7

AFF4, AF4/FMR2 family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF4Q9UHB7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AFF4Q9UHB7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
AFF4Q9UHB7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AFF4Q9UHB7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AFF4Q9UHB7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AFF4Q9UHB7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AFF4Q9UHB7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25■■□□□ 1.59
AFF4Q9UHB7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
AFF4Q9UHB7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
AFF4Q9UHB7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
AFF4Q9UHB7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
AFF4Q9UHB7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
AFF4Q9UHB7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
AFF4Q9UHB7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AFF4Q9UHB7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AFF4Q9UHB7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AFF4Q9UHB7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AFF4Q9UHB7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AFF4Q9UHB7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AFF4Q9UHB7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AFF4Q9UHB7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
AFF4Q9UHB7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
AFF4Q9UHB7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AFF4Q9UHB7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AFF4Q9UHB7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AFF4Q9UHB7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AFF4Q9UHB7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AFF4Q9UHB7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AFF4Q9UHB7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AFF4Q9UHB7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
AFF4Q9UHB7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
AFF4Q9UHB7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AFF4Q9UHB7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AFF4Q9UHB7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AFF4Q9UHB7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AFF4Q9UHB7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AFF4Q9UHB7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AFF4Q9UHB7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AFF4Q9UHB7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AFF4Q9UHB7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AFF4Q9UHB7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AFF4Q9UHB7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AFF4Q9UHB7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AFF4Q9UHB7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AFF4Q9UHB7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AFF4Q9UHB7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AFF4Q9UHB7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AFF4Q9UHB7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AFF4Q9UHB7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AFF4Q9UHB7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AFF4Q9UHB7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AFF4Q9UHB7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AFF4Q9UHB7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AFF4Q9UHB7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AFF4Q9UHB7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AFF4Q9UHB7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AFF4Q9UHB7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AFF4Q9UHB7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AFF4Q9UHB7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AFF4Q9UHB7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AFF4Q9UHB7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
AFF4Q9UHB7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AFF4Q9UHB7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AFF4Q9UHB7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AFF4Q9UHB7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AFF4Q9UHB7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AFF4Q9UHB7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AFF4Q9UHB7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AFF4Q9UHB7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AFF4Q9UHB7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AFF4Q9UHB7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AFF4Q9UHB7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AFF4Q9UHB7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AFF4Q9UHB7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AFF4Q9UHB7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AFF4Q9UHB7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AFF4Q9UHB7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AFF4Q9UHB7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
AFF4Q9UHB7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AFF4Q9UHB7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AFF4Q9UHB7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AFF4Q9UHB7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AFF4Q9UHB7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AFF4Q9UHB7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AFF4Q9UHB7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AFF4Q9UHB7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AFF4Q9UHB7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AFF4Q9UHB7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AFF4Q9UHB7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AFF4Q9UHB7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AFF4Q9UHB7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AFF4Q9UHB7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AFF4Q9UHB7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AFF4Q9UHB7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AFF4Q9UHB7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AFF4Q9UHB7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AFF4Q9UHB7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
AFF4Q9UHB7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
AFF4Q9UHB7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AFF4Q9UHB7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms