Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGJ1

TUBGCP4, Gamma-tubulin complex component 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP4Q9UGJ1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBGCP4Q9UGJ1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBGCP4Q9UGJ1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBGCP4Q9UGJ1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBGCP4Q9UGJ1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBGCP4Q9UGJ1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBGCP4Q9UGJ1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBGCP4Q9UGJ1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBGCP4Q9UGJ1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBGCP4Q9UGJ1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBGCP4Q9UGJ1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBGCP4Q9UGJ1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBGCP4Q9UGJ1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBGCP4Q9UGJ1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
TUBGCP4Q9UGJ1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBGCP4Q9UGJ1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBGCP4Q9UGJ1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBGCP4Q9UGJ1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBGCP4Q9UGJ1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBGCP4Q9UGJ1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBGCP4Q9UGJ1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBGCP4Q9UGJ1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBGCP4Q9UGJ1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBGCP4Q9UGJ1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBGCP4Q9UGJ1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBGCP4Q9UGJ1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBGCP4Q9UGJ1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBGCP4Q9UGJ1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBGCP4Q9UGJ1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBGCP4Q9UGJ1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBGCP4Q9UGJ1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBGCP4Q9UGJ1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBGCP4Q9UGJ1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBGCP4Q9UGJ1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBGCP4Q9UGJ1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBGCP4Q9UGJ1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBGCP4Q9UGJ1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBGCP4Q9UGJ1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBGCP4Q9UGJ1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBGCP4Q9UGJ1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBGCP4Q9UGJ1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBGCP4Q9UGJ1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBGCP4Q9UGJ1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBGCP4Q9UGJ1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBGCP4Q9UGJ1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBGCP4Q9UGJ1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TUBGCP4Q9UGJ1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBGCP4Q9UGJ1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBGCP4Q9UGJ1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBGCP4Q9UGJ1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBGCP4Q9UGJ1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBGCP4Q9UGJ1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBGCP4Q9UGJ1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBGCP4Q9UGJ1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBGCP4Q9UGJ1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBGCP4Q9UGJ1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBGCP4Q9UGJ1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBGCP4Q9UGJ1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBGCP4Q9UGJ1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBGCP4Q9UGJ1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBGCP4Q9UGJ1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBGCP4Q9UGJ1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBGCP4Q9UGJ1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBGCP4Q9UGJ1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBGCP4Q9UGJ1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBGCP4Q9UGJ1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBGCP4Q9UGJ1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBGCP4Q9UGJ1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBGCP4Q9UGJ1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBGCP4Q9UGJ1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBGCP4Q9UGJ1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBGCP4Q9UGJ1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBGCP4Q9UGJ1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBGCP4Q9UGJ1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBGCP4Q9UGJ1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBGCP4Q9UGJ1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBGCP4Q9UGJ1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBGCP4Q9UGJ1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBGCP4Q9UGJ1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBGCP4Q9UGJ1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBGCP4Q9UGJ1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBGCP4Q9UGJ1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBGCP4Q9UGJ1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBGCP4Q9UGJ1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBGCP4Q9UGJ1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBGCP4Q9UGJ1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBGCP4Q9UGJ1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBGCP4Q9UGJ1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBGCP4Q9UGJ1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBGCP4Q9UGJ1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBGCP4Q9UGJ1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBGCP4Q9UGJ1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBGCP4Q9UGJ1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBGCP4Q9UGJ1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBGCP4Q9UGJ1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBGCP4Q9UGJ1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBGCP4Q9UGJ1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBGCP4Q9UGJ1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBGCP4Q9UGJ1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBGCP4Q9UGJ1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms