Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY6

TRIM10, Tripartite motif-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM10Q9UDY6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIM10Q9UDY6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM10Q9UDY6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM10Q9UDY6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM10Q9UDY6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM10Q9UDY6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM10Q9UDY6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM10Q9UDY6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM10Q9UDY6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM10Q9UDY6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM10Q9UDY6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM10Q9UDY6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM10Q9UDY6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM10Q9UDY6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM10Q9UDY6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM10Q9UDY6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM10Q9UDY6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM10Q9UDY6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM10Q9UDY6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM10Q9UDY6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM10Q9UDY6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM10Q9UDY6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM10Q9UDY6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM10Q9UDY6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM10Q9UDY6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM10Q9UDY6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM10Q9UDY6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM10Q9UDY6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM10Q9UDY6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM10Q9UDY6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM10Q9UDY6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM10Q9UDY6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM10Q9UDY6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM10Q9UDY6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM10Q9UDY6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM10Q9UDY6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM10Q9UDY6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM10Q9UDY6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM10Q9UDY6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM10Q9UDY6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM10Q9UDY6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM10Q9UDY6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM10Q9UDY6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM10Q9UDY6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM10Q9UDY6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM10Q9UDY6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM10Q9UDY6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM10Q9UDY6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM10Q9UDY6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms