Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSFQ9UBX1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSFQ9UBX1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSFQ9UBX1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSFQ9UBX1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSFQ9UBX1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSFQ9UBX1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSFQ9UBX1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSFQ9UBX1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSFQ9UBX1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSFQ9UBX1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSFQ9UBX1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSFQ9UBX1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSFQ9UBX1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSFQ9UBX1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSFQ9UBX1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSFQ9UBX1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSFQ9UBX1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSFQ9UBX1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSFQ9UBX1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSFQ9UBX1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSFQ9UBX1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSFQ9UBX1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSFQ9UBX1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSFQ9UBX1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSFQ9UBX1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSFQ9UBX1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSFQ9UBX1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSFQ9UBX1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSFQ9UBX1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSFQ9UBX1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSFQ9UBX1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSFQ9UBX1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSFQ9UBX1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSFQ9UBX1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSFQ9UBX1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSFQ9UBX1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSFQ9UBX1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSFQ9UBX1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSFQ9UBX1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSFQ9UBX1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSFQ9UBX1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSFQ9UBX1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSFQ9UBX1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSFQ9UBX1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSFQ9UBX1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSFQ9UBX1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSFQ9UBX1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSFQ9UBX1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSFQ9UBX1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSFQ9UBX1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSFQ9UBX1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSFQ9UBX1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSFQ9UBX1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSFQ9UBX1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSFQ9UBX1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSFQ9UBX1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSFQ9UBX1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSFQ9UBX1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSFQ9UBX1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSFQ9UBX1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSFQ9UBX1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSFQ9UBX1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSFQ9UBX1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSFQ9UBX1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSFQ9UBX1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSFQ9UBX1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSFQ9UBX1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSFQ9UBX1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSFQ9UBX1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSFQ9UBX1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSFQ9UBX1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSFQ9UBX1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSFQ9UBX1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CTSFQ9UBX1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSFQ9UBX1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSFQ9UBX1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSFQ9UBX1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSFQ9UBX1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSFQ9UBX1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSFQ9UBX1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSFQ9UBX1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSFQ9UBX1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSFQ9UBX1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSFQ9UBX1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSFQ9UBX1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSFQ9UBX1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSFQ9UBX1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSFQ9UBX1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSFQ9UBX1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSFQ9UBX1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSFQ9UBX1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSFQ9UBX1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSFQ9UBX1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSFQ9UBX1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSFQ9UBX1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSFQ9UBX1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSFQ9UBX1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSFQ9UBX1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSFQ9UBX1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.6 ms