Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NXF1Q9UBU9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NXF1Q9UBU9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NXF1Q9UBU9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NXF1Q9UBU9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NXF1Q9UBU9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NXF1Q9UBU9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NXF1Q9UBU9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NXF1Q9UBU9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NXF1Q9UBU9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NXF1Q9UBU9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NXF1Q9UBU9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NXF1Q9UBU9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NXF1Q9UBU9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NXF1Q9UBU9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NXF1Q9UBU9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NXF1Q9UBU9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NXF1Q9UBU9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NXF1Q9UBU9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NXF1Q9UBU9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NXF1Q9UBU9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NXF1Q9UBU9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NXF1Q9UBU9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NXF1Q9UBU9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NXF1Q9UBU9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NXF1Q9UBU9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NXF1Q9UBU9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NXF1Q9UBU9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NXF1Q9UBU9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NXF1Q9UBU9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NXF1Q9UBU9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NXF1Q9UBU9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NXF1Q9UBU9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NXF1Q9UBU9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NXF1Q9UBU9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NXF1Q9UBU9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NXF1Q9UBU9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NXF1Q9UBU9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NXF1Q9UBU9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NXF1Q9UBU9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NXF1Q9UBU9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NXF1Q9UBU9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NXF1Q9UBU9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NXF1Q9UBU9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NXF1Q9UBU9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NXF1Q9UBU9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NXF1Q9UBU9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NXF1Q9UBU9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NXF1Q9UBU9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NXF1Q9UBU9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NXF1Q9UBU9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NXF1Q9UBU9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NXF1Q9UBU9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NXF1Q9UBU9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NXF1Q9UBU9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NXF1Q9UBU9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NXF1Q9UBU9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NXF1Q9UBU9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NXF1Q9UBU9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NXF1Q9UBU9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NXF1Q9UBU9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NXF1Q9UBU9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NXF1Q9UBU9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NXF1Q9UBU9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NXF1Q9UBU9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NXF1Q9UBU9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NXF1Q9UBU9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NXF1Q9UBU9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NXF1Q9UBU9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NXF1Q9UBU9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NXF1Q9UBU9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NXF1Q9UBU9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NXF1Q9UBU9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NXF1Q9UBU9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NXF1Q9UBU9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NXF1Q9UBU9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NXF1Q9UBU9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NXF1Q9UBU9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NXF1Q9UBU9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NXF1Q9UBU9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NXF1Q9UBU9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NXF1Q9UBU9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NXF1Q9UBU9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NXF1Q9UBU9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NXF1Q9UBU9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NXF1Q9UBU9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NXF1Q9UBU9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NXF1Q9UBU9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NXF1Q9UBU9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NXF1Q9UBU9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NXF1Q9UBU9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NXF1Q9UBU9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NXF1Q9UBU9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NXF1Q9UBU9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NXF1Q9UBU9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NXF1Q9UBU9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NXF1Q9UBU9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NXF1Q9UBU9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NXF1Q9UBU9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NXF1Q9UBU9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 215.3 ms