Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HMG20BQ9P0W2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HMG20BQ9P0W2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HMG20BQ9P0W2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HMG20BQ9P0W2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HMG20BQ9P0W2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HMG20BQ9P0W2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HMG20BQ9P0W2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
HMG20BQ9P0W2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HMG20BQ9P0W2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HMG20BQ9P0W2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HMG20BQ9P0W2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HMG20BQ9P0W2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HMG20BQ9P0W2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HMG20BQ9P0W2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HMG20BQ9P0W2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
HMG20BQ9P0W2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
HMG20BQ9P0W2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HMG20BQ9P0W2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HMG20BQ9P0W2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HMG20BQ9P0W2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HMG20BQ9P0W2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HMG20BQ9P0W2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HMG20BQ9P0W2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HMG20BQ9P0W2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
HMG20BQ9P0W2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HMG20BQ9P0W2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HMG20BQ9P0W2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HMG20BQ9P0W2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HMG20BQ9P0W2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HMG20BQ9P0W2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HMG20BQ9P0W2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HMG20BQ9P0W2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
HMG20BQ9P0W2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HMG20BQ9P0W2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HMG20BQ9P0W2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HMG20BQ9P0W2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HMG20BQ9P0W2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HMG20BQ9P0W2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HMG20BQ9P0W2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HMG20BQ9P0W2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HMG20BQ9P0W2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HMG20BQ9P0W2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HMG20BQ9P0W2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
HMG20BQ9P0W2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HMG20BQ9P0W2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HMG20BQ9P0W2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HMG20BQ9P0W2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
HMG20BQ9P0W2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HMG20BQ9P0W2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HMG20BQ9P0W2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HMG20BQ9P0W2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HMG20BQ9P0W2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HMG20BQ9P0W2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HMG20BQ9P0W2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HMG20BQ9P0W2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HMG20BQ9P0W2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HMG20BQ9P0W2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HMG20BQ9P0W2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HMG20BQ9P0W2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HMG20BQ9P0W2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HMG20BQ9P0W2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HMG20BQ9P0W2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HMG20BQ9P0W2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
HMG20BQ9P0W2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HMG20BQ9P0W2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HMG20BQ9P0W2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HMG20BQ9P0W2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HMG20BQ9P0W2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HMG20BQ9P0W2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HMG20BQ9P0W2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HMG20BQ9P0W2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
HMG20BQ9P0W2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HMG20BQ9P0W2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HMG20BQ9P0W2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HMG20BQ9P0W2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HMG20BQ9P0W2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
HMG20BQ9P0W2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HMG20BQ9P0W2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HMG20BQ9P0W2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HMG20BQ9P0W2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HMG20BQ9P0W2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HMG20BQ9P0W2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HMG20BQ9P0W2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HMG20BQ9P0W2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HMG20BQ9P0W2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HMG20BQ9P0W2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HMG20BQ9P0W2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HMG20BQ9P0W2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HMG20BQ9P0W2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HMG20BQ9P0W2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HMG20BQ9P0W2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HMG20BQ9P0W2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HMG20BQ9P0W2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HMG20BQ9P0W2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
HMG20BQ9P0W2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HMG20BQ9P0W2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HMG20BQ9P0W2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HMG20BQ9P0W2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HMG20BQ9P0W2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms