Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ3

NCKIPSD, NCK-interacting protein with SH3 domain, humanhuman

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKIPSDQ9NZQ3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCKIPSDQ9NZQ3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCKIPSDQ9NZQ3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCKIPSDQ9NZQ3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCKIPSDQ9NZQ3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCKIPSDQ9NZQ3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCKIPSDQ9NZQ3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCKIPSDQ9NZQ3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCKIPSDQ9NZQ3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCKIPSDQ9NZQ3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCKIPSDQ9NZQ3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCKIPSDQ9NZQ3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NCKIPSDQ9NZQ3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCKIPSDQ9NZQ3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCKIPSDQ9NZQ3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCKIPSDQ9NZQ3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NCKIPSDQ9NZQ3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCKIPSDQ9NZQ3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCKIPSDQ9NZQ3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCKIPSDQ9NZQ3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCKIPSDQ9NZQ3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCKIPSDQ9NZQ3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCKIPSDQ9NZQ3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCKIPSDQ9NZQ3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCKIPSDQ9NZQ3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCKIPSDQ9NZQ3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCKIPSDQ9NZQ3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCKIPSDQ9NZQ3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCKIPSDQ9NZQ3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCKIPSDQ9NZQ3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NCKIPSDQ9NZQ3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCKIPSDQ9NZQ3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCKIPSDQ9NZQ3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCKIPSDQ9NZQ3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCKIPSDQ9NZQ3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCKIPSDQ9NZQ3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCKIPSDQ9NZQ3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCKIPSDQ9NZQ3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCKIPSDQ9NZQ3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCKIPSDQ9NZQ3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NCKIPSDQ9NZQ3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCKIPSDQ9NZQ3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCKIPSDQ9NZQ3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCKIPSDQ9NZQ3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCKIPSDQ9NZQ3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCKIPSDQ9NZQ3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NCKIPSDQ9NZQ3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCKIPSDQ9NZQ3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCKIPSDQ9NZQ3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCKIPSDQ9NZQ3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCKIPSDQ9NZQ3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCKIPSDQ9NZQ3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCKIPSDQ9NZQ3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCKIPSDQ9NZQ3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCKIPSDQ9NZQ3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCKIPSDQ9NZQ3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCKIPSDQ9NZQ3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCKIPSDQ9NZQ3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCKIPSDQ9NZQ3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCKIPSDQ9NZQ3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NCKIPSDQ9NZQ3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCKIPSDQ9NZQ3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCKIPSDQ9NZQ3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCKIPSDQ9NZQ3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCKIPSDQ9NZQ3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NCKIPSDQ9NZQ3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCKIPSDQ9NZQ3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCKIPSDQ9NZQ3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCKIPSDQ9NZQ3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCKIPSDQ9NZQ3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCKIPSDQ9NZQ3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NCKIPSDQ9NZQ3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCKIPSDQ9NZQ3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCKIPSDQ9NZQ3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCKIPSDQ9NZQ3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCKIPSDQ9NZQ3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCKIPSDQ9NZQ3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCKIPSDQ9NZQ3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCKIPSDQ9NZQ3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCKIPSDQ9NZQ3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCKIPSDQ9NZQ3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCKIPSDQ9NZQ3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NCKIPSDQ9NZQ3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NCKIPSDQ9NZQ3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NCKIPSDQ9NZQ3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCKIPSDQ9NZQ3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCKIPSDQ9NZQ3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCKIPSDQ9NZQ3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCKIPSDQ9NZQ3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCKIPSDQ9NZQ3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCKIPSDQ9NZQ3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NCKIPSDQ9NZQ3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCKIPSDQ9NZQ3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCKIPSDQ9NZQ3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCKIPSDQ9NZQ3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms