Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY65

TUBA8, Tubulin alpha-8 chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA8Q9NY65 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBA8Q9NY65 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBA8Q9NY65 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBA8Q9NY65 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBA8Q9NY65 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBA8Q9NY65 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBA8Q9NY65 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBA8Q9NY65 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBA8Q9NY65 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBA8Q9NY65 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBA8Q9NY65 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBA8Q9NY65 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBA8Q9NY65 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBA8Q9NY65 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBA8Q9NY65 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBA8Q9NY65 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBA8Q9NY65 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBA8Q9NY65 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBA8Q9NY65 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBA8Q9NY65 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBA8Q9NY65 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBA8Q9NY65 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBA8Q9NY65 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBA8Q9NY65 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBA8Q9NY65 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBA8Q9NY65 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBA8Q9NY65 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBA8Q9NY65 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBA8Q9NY65 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBA8Q9NY65 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBA8Q9NY65 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBA8Q9NY65 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBA8Q9NY65 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBA8Q9NY65 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBA8Q9NY65 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBA8Q9NY65 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBA8Q9NY65 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBA8Q9NY65 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBA8Q9NY65 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBA8Q9NY65 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBA8Q9NY65 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TUBA8Q9NY65 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TUBA8Q9NY65 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TUBA8Q9NY65 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TUBA8Q9NY65 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBA8Q9NY65 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBA8Q9NY65 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBA8Q9NY65 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBA8Q9NY65 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBA8Q9NY65 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBA8Q9NY65 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms