Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY43

BARHL2, BarH-like 2 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL2Q9NY43 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BARHL2Q9NY43 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BARHL2Q9NY43 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BARHL2Q9NY43 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BARHL2Q9NY43 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BARHL2Q9NY43 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BARHL2Q9NY43 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BARHL2Q9NY43 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BARHL2Q9NY43 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BARHL2Q9NY43 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BARHL2Q9NY43 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BARHL2Q9NY43 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
BARHL2Q9NY43 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BARHL2Q9NY43 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BARHL2Q9NY43 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BARHL2Q9NY43 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
BARHL2Q9NY43 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BARHL2Q9NY43 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BARHL2Q9NY43 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BARHL2Q9NY43 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BARHL2Q9NY43 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BARHL2Q9NY43 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BARHL2Q9NY43 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BARHL2Q9NY43 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BARHL2Q9NY43 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BARHL2Q9NY43 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
BARHL2Q9NY43 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BARHL2Q9NY43 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BARHL2Q9NY43 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BARHL2Q9NY43 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BARHL2Q9NY43 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BARHL2Q9NY43 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BARHL2Q9NY43 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BARHL2Q9NY43 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BARHL2Q9NY43 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BARHL2Q9NY43 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BARHL2Q9NY43 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BARHL2Q9NY43 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BARHL2Q9NY43 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BARHL2Q9NY43 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BARHL2Q9NY43 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BARHL2Q9NY43 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BARHL2Q9NY43 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
BARHL2Q9NY43 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
BARHL2Q9NY43 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
BARHL2Q9NY43 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BARHL2Q9NY43 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BARHL2Q9NY43 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BARHL2Q9NY43 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BARHL2Q9NY43 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BARHL2Q9NY43 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
BARHL2Q9NY43 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BARHL2Q9NY43 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BARHL2Q9NY43 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BARHL2Q9NY43 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BARHL2Q9NY43 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BARHL2Q9NY43 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BARHL2Q9NY43 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BARHL2Q9NY43 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BARHL2Q9NY43 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BARHL2Q9NY43 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BARHL2Q9NY43 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BARHL2Q9NY43 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BARHL2Q9NY43 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BARHL2Q9NY43 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BARHL2Q9NY43 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BARHL2Q9NY43 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BARHL2Q9NY43 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BARHL2Q9NY43 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BARHL2Q9NY43 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BARHL2Q9NY43 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BARHL2Q9NY43 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BARHL2Q9NY43 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BARHL2Q9NY43 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BARHL2Q9NY43 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BARHL2Q9NY43 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BARHL2Q9NY43 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BARHL2Q9NY43 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BARHL2Q9NY43 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BARHL2Q9NY43 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BARHL2Q9NY43 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BARHL2Q9NY43 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BARHL2Q9NY43 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BARHL2Q9NY43 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BARHL2Q9NY43 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
BARHL2Q9NY43 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BARHL2Q9NY43 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BARHL2Q9NY43 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BARHL2Q9NY43 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BARHL2Q9NY43 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BARHL2Q9NY43 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BARHL2Q9NY43 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
BARHL2Q9NY43 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BARHL2Q9NY43 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BARHL2Q9NY43 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BARHL2Q9NY43 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BARHL2Q9NY43 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BARHL2Q9NY43 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BARHL2Q9NY43 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BARHL2Q9NY43 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms