Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXX6

NSMCE4A, Non-structural maintenance of chromosomes element 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE4AQ9NXX6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NSMCE4AQ9NXX6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NSMCE4AQ9NXX6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NSMCE4AQ9NXX6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NSMCE4AQ9NXX6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NSMCE4AQ9NXX6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NSMCE4AQ9NXX6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSMCE4AQ9NXX6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSMCE4AQ9NXX6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSMCE4AQ9NXX6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSMCE4AQ9NXX6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSMCE4AQ9NXX6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSMCE4AQ9NXX6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSMCE4AQ9NXX6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSMCE4AQ9NXX6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSMCE4AQ9NXX6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSMCE4AQ9NXX6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSMCE4AQ9NXX6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSMCE4AQ9NXX6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSMCE4AQ9NXX6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSMCE4AQ9NXX6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSMCE4AQ9NXX6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSMCE4AQ9NXX6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSMCE4AQ9NXX6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSMCE4AQ9NXX6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSMCE4AQ9NXX6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSMCE4AQ9NXX6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSMCE4AQ9NXX6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSMCE4AQ9NXX6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSMCE4AQ9NXX6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSMCE4AQ9NXX6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSMCE4AQ9NXX6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSMCE4AQ9NXX6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NSMCE4AQ9NXX6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSMCE4AQ9NXX6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSMCE4AQ9NXX6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSMCE4AQ9NXX6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSMCE4AQ9NXX6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSMCE4AQ9NXX6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSMCE4AQ9NXX6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSMCE4AQ9NXX6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSMCE4AQ9NXX6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSMCE4AQ9NXX6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSMCE4AQ9NXX6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSMCE4AQ9NXX6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSMCE4AQ9NXX6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSMCE4AQ9NXX6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSMCE4AQ9NXX6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSMCE4AQ9NXX6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSMCE4AQ9NXX6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NSMCE4AQ9NXX6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSMCE4AQ9NXX6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSMCE4AQ9NXX6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSMCE4AQ9NXX6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSMCE4AQ9NXX6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSMCE4AQ9NXX6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSMCE4AQ9NXX6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSMCE4AQ9NXX6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSMCE4AQ9NXX6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSMCE4AQ9NXX6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NSMCE4AQ9NXX6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSMCE4AQ9NXX6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSMCE4AQ9NXX6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSMCE4AQ9NXX6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSMCE4AQ9NXX6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSMCE4AQ9NXX6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSMCE4AQ9NXX6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSMCE4AQ9NXX6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSMCE4AQ9NXX6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSMCE4AQ9NXX6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSMCE4AQ9NXX6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSMCE4AQ9NXX6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSMCE4AQ9NXX6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSMCE4AQ9NXX6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NSMCE4AQ9NXX6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSMCE4AQ9NXX6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSMCE4AQ9NXX6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSMCE4AQ9NXX6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSMCE4AQ9NXX6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSMCE4AQ9NXX6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSMCE4AQ9NXX6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSMCE4AQ9NXX6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSMCE4AQ9NXX6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NSMCE4AQ9NXX6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NSMCE4AQ9NXX6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NSMCE4AQ9NXX6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NSMCE4AQ9NXX6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NSMCE4AQ9NXX6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NSMCE4AQ9NXX6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSMCE4AQ9NXX6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSMCE4AQ9NXX6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSMCE4AQ9NXX6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSMCE4AQ9NXX6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSMCE4AQ9NXX6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSMCE4AQ9NXX6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSMCE4AQ9NXX6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSMCE4AQ9NXX6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSMCE4AQ9NXX6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSMCE4AQ9NXX6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSMCE4AQ9NXX6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms