Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GIN1Q9NXP7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GIN1Q9NXP7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GIN1Q9NXP7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GIN1Q9NXP7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GIN1Q9NXP7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GIN1Q9NXP7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GIN1Q9NXP7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GIN1Q9NXP7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GIN1Q9NXP7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GIN1Q9NXP7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GIN1Q9NXP7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GIN1Q9NXP7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GIN1Q9NXP7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GIN1Q9NXP7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GIN1Q9NXP7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GIN1Q9NXP7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GIN1Q9NXP7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GIN1Q9NXP7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GIN1Q9NXP7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GIN1Q9NXP7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GIN1Q9NXP7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GIN1Q9NXP7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GIN1Q9NXP7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GIN1Q9NXP7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GIN1Q9NXP7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GIN1Q9NXP7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GIN1Q9NXP7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GIN1Q9NXP7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GIN1Q9NXP7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GIN1Q9NXP7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GIN1Q9NXP7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GIN1Q9NXP7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GIN1Q9NXP7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GIN1Q9NXP7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GIN1Q9NXP7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GIN1Q9NXP7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GIN1Q9NXP7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GIN1Q9NXP7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GIN1Q9NXP7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIN1Q9NXP7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIN1Q9NXP7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIN1Q9NXP7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIN1Q9NXP7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIN1Q9NXP7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIN1Q9NXP7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIN1Q9NXP7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIN1Q9NXP7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIN1Q9NXP7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIN1Q9NXP7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GIN1Q9NXP7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIN1Q9NXP7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIN1Q9NXP7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIN1Q9NXP7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIN1Q9NXP7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIN1Q9NXP7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIN1Q9NXP7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIN1Q9NXP7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GIN1Q9NXP7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GIN1Q9NXP7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GIN1Q9NXP7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GIN1Q9NXP7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GIN1Q9NXP7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GIN1Q9NXP7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GIN1Q9NXP7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GIN1Q9NXP7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GIN1Q9NXP7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms