Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms