Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWT1

PAK1IP1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAK1IP1Q9NWT1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PAK1IP1Q9NWT1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAK1IP1Q9NWT1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAK1IP1Q9NWT1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAK1IP1Q9NWT1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAK1IP1Q9NWT1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAK1IP1Q9NWT1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAK1IP1Q9NWT1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAK1IP1Q9NWT1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAK1IP1Q9NWT1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAK1IP1Q9NWT1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAK1IP1Q9NWT1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAK1IP1Q9NWT1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAK1IP1Q9NWT1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAK1IP1Q9NWT1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAK1IP1Q9NWT1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAK1IP1Q9NWT1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAK1IP1Q9NWT1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAK1IP1Q9NWT1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAK1IP1Q9NWT1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAK1IP1Q9NWT1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAK1IP1Q9NWT1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAK1IP1Q9NWT1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAK1IP1Q9NWT1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAK1IP1Q9NWT1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAK1IP1Q9NWT1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAK1IP1Q9NWT1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAK1IP1Q9NWT1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAK1IP1Q9NWT1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAK1IP1Q9NWT1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAK1IP1Q9NWT1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAK1IP1Q9NWT1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAK1IP1Q9NWT1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAK1IP1Q9NWT1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAK1IP1Q9NWT1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAK1IP1Q9NWT1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAK1IP1Q9NWT1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAK1IP1Q9NWT1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAK1IP1Q9NWT1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAK1IP1Q9NWT1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAK1IP1Q9NWT1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAK1IP1Q9NWT1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAK1IP1Q9NWT1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAK1IP1Q9NWT1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAK1IP1Q9NWT1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAK1IP1Q9NWT1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAK1IP1Q9NWT1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAK1IP1Q9NWT1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAK1IP1Q9NWT1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAK1IP1Q9NWT1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAK1IP1Q9NWT1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAK1IP1Q9NWT1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAK1IP1Q9NWT1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PAK1IP1Q9NWT1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAK1IP1Q9NWT1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAK1IP1Q9NWT1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAK1IP1Q9NWT1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PAK1IP1Q9NWT1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAK1IP1Q9NWT1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAK1IP1Q9NWT1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAK1IP1Q9NWT1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAK1IP1Q9NWT1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAK1IP1Q9NWT1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAK1IP1Q9NWT1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAK1IP1Q9NWT1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAK1IP1Q9NWT1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAK1IP1Q9NWT1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAK1IP1Q9NWT1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAK1IP1Q9NWT1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAK1IP1Q9NWT1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAK1IP1Q9NWT1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAK1IP1Q9NWT1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAK1IP1Q9NWT1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAK1IP1Q9NWT1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAK1IP1Q9NWT1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAK1IP1Q9NWT1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PAK1IP1Q9NWT1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAK1IP1Q9NWT1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAK1IP1Q9NWT1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAK1IP1Q9NWT1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAK1IP1Q9NWT1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAK1IP1Q9NWT1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAK1IP1Q9NWT1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAK1IP1Q9NWT1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAK1IP1Q9NWT1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAK1IP1Q9NWT1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAK1IP1Q9NWT1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAK1IP1Q9NWT1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PAK1IP1Q9NWT1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PAK1IP1Q9NWT1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
PAK1IP1Q9NWT1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PAK1IP1Q9NWT1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PAK1IP1Q9NWT1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PAK1IP1Q9NWT1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAK1IP1Q9NWT1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PAK1IP1Q9NWT1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAK1IP1Q9NWT1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAK1IP1Q9NWT1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAK1IP1Q9NWT1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PAK1IP1Q9NWT1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms