Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FANCLQ9NW38 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
FANCLQ9NW38 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FANCLQ9NW38 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FANCLQ9NW38 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FANCLQ9NW38 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FANCLQ9NW38 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FANCLQ9NW38 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCLQ9NW38 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCLQ9NW38 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCLQ9NW38 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCLQ9NW38 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCLQ9NW38 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCLQ9NW38 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FANCLQ9NW38 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FANCLQ9NW38 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FANCLQ9NW38 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FANCLQ9NW38 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FANCLQ9NW38 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FANCLQ9NW38 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FANCLQ9NW38 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FANCLQ9NW38 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FANCLQ9NW38 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FANCLQ9NW38 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FANCLQ9NW38 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FANCLQ9NW38 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FANCLQ9NW38 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FANCLQ9NW38 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FANCLQ9NW38 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FANCLQ9NW38 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FANCLQ9NW38 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FANCLQ9NW38 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FANCLQ9NW38 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FANCLQ9NW38 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FANCLQ9NW38 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FANCLQ9NW38 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FANCLQ9NW38 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FANCLQ9NW38 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FANCLQ9NW38 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FANCLQ9NW38 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FANCLQ9NW38 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FANCLQ9NW38 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms