Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLR3EQ9NVU0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLR3EQ9NVU0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLR3EQ9NVU0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLR3EQ9NVU0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLR3EQ9NVU0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLR3EQ9NVU0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR3EQ9NVU0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR3EQ9NVU0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR3EQ9NVU0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR3EQ9NVU0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR3EQ9NVU0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR3EQ9NVU0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR3EQ9NVU0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR3EQ9NVU0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR3EQ9NVU0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR3EQ9NVU0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR3EQ9NVU0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR3EQ9NVU0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR3EQ9NVU0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR3EQ9NVU0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR3EQ9NVU0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR3EQ9NVU0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR3EQ9NVU0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR3EQ9NVU0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR3EQ9NVU0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR3EQ9NVU0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR3EQ9NVU0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR3EQ9NVU0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR3EQ9NVU0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR3EQ9NVU0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR3EQ9NVU0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR3EQ9NVU0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR3EQ9NVU0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR3EQ9NVU0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR3EQ9NVU0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR3EQ9NVU0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR3EQ9NVU0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR3EQ9NVU0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR3EQ9NVU0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR3EQ9NVU0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR3EQ9NVU0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR3EQ9NVU0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR3EQ9NVU0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLR3EQ9NVU0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
POLR3EQ9NVU0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
POLR3EQ9NVU0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
POLR3EQ9NVU0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
POLR3EQ9NVU0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
POLR3EQ9NVU0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
POLR3EQ9NVU0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR3EQ9NVU0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR3EQ9NVU0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR3EQ9NVU0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR3EQ9NVU0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR3EQ9NVU0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR3EQ9NVU0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR3EQ9NVU0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR3EQ9NVU0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR3EQ9NVU0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR3EQ9NVU0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR3EQ9NVU0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR3EQ9NVU0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR3EQ9NVU0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR3EQ9NVU0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR3EQ9NVU0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR3EQ9NVU0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR3EQ9NVU0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR3EQ9NVU0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR3EQ9NVU0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR3EQ9NVU0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR3EQ9NVU0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR3EQ9NVU0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR3EQ9NVU0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR3EQ9NVU0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR3EQ9NVU0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR3EQ9NVU0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR3EQ9NVU0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR3EQ9NVU0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR3EQ9NVU0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR3EQ9NVU0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR3EQ9NVU0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR3EQ9NVU0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR3EQ9NVU0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR3EQ9NVU0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR3EQ9NVU0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR3EQ9NVU0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR3EQ9NVU0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR3EQ9NVU0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR3EQ9NVU0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR3EQ9NVU0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR3EQ9NVU0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR3EQ9NVU0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLR3EQ9NVU0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLR3EQ9NVU0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLR3EQ9NVU0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
POLR3EQ9NVU0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLR3EQ9NVU0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLR3EQ9NVU0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLR3EQ9NVU0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms