Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FBXO28Q9NVF7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FBXO28Q9NVF7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FBXO28Q9NVF7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FBXO28Q9NVF7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FBXO28Q9NVF7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FBXO28Q9NVF7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FBXO28Q9NVF7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
FBXO28Q9NVF7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FBXO28Q9NVF7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FBXO28Q9NVF7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FBXO28Q9NVF7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FBXO28Q9NVF7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FBXO28Q9NVF7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FBXO28Q9NVF7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FBXO28Q9NVF7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FBXO28Q9NVF7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FBXO28Q9NVF7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FBXO28Q9NVF7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FBXO28Q9NVF7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FBXO28Q9NVF7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FBXO28Q9NVF7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FBXO28Q9NVF7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
FBXO28Q9NVF7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
FBXO28Q9NVF7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FBXO28Q9NVF7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FBXO28Q9NVF7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FBXO28Q9NVF7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FBXO28Q9NVF7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FBXO28Q9NVF7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FBXO28Q9NVF7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FBXO28Q9NVF7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FBXO28Q9NVF7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FBXO28Q9NVF7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FBXO28Q9NVF7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FBXO28Q9NVF7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
FBXO28Q9NVF7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FBXO28Q9NVF7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FBXO28Q9NVF7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FBXO28Q9NVF7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FBXO28Q9NVF7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FBXO28Q9NVF7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FBXO28Q9NVF7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FBXO28Q9NVF7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FBXO28Q9NVF7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FBXO28Q9NVF7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FBXO28Q9NVF7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FBXO28Q9NVF7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FBXO28Q9NVF7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
FBXO28Q9NVF7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FBXO28Q9NVF7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FBXO28Q9NVF7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FBXO28Q9NVF7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FBXO28Q9NVF7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FBXO28Q9NVF7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FBXO28Q9NVF7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FBXO28Q9NVF7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FBXO28Q9NVF7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FBXO28Q9NVF7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FBXO28Q9NVF7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FBXO28Q9NVF7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FBXO28Q9NVF7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FBXO28Q9NVF7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FBXO28Q9NVF7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FBXO28Q9NVF7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FBXO28Q9NVF7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FBXO28Q9NVF7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FBXO28Q9NVF7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FBXO28Q9NVF7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FBXO28Q9NVF7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
FBXO28Q9NVF7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FBXO28Q9NVF7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FBXO28Q9NVF7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
FBXO28Q9NVF7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
FBXO28Q9NVF7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FBXO28Q9NVF7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FBXO28Q9NVF7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FBXO28Q9NVF7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FBXO28Q9NVF7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FBXO28Q9NVF7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FBXO28Q9NVF7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FBXO28Q9NVF7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FBXO28Q9NVF7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FBXO28Q9NVF7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FBXO28Q9NVF7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FBXO28Q9NVF7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FBXO28Q9NVF7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FBXO28Q9NVF7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
FBXO28Q9NVF7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FBXO28Q9NVF7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FBXO28Q9NVF7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FBXO28Q9NVF7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FBXO28Q9NVF7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FBXO28Q9NVF7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FBXO28Q9NVF7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FBXO28Q9NVF7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FBXO28Q9NVF7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
FBXO28Q9NVF7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FBXO28Q9NVF7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FBXO28Q9NVF7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms