Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCM2LQ9NUG4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCM2LQ9NUG4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCM2LQ9NUG4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCM2LQ9NUG4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCM2LQ9NUG4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCM2LQ9NUG4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCM2LQ9NUG4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCM2LQ9NUG4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCM2LQ9NUG4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCM2LQ9NUG4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCM2LQ9NUG4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCM2LQ9NUG4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCM2LQ9NUG4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCM2LQ9NUG4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCM2LQ9NUG4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCM2LQ9NUG4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCM2LQ9NUG4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCM2LQ9NUG4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCM2LQ9NUG4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCM2LQ9NUG4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCM2LQ9NUG4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCM2LQ9NUG4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCM2LQ9NUG4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCM2LQ9NUG4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCM2LQ9NUG4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCM2LQ9NUG4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCM2LQ9NUG4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCM2LQ9NUG4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCM2LQ9NUG4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCM2LQ9NUG4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCM2LQ9NUG4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCM2LQ9NUG4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCM2LQ9NUG4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCM2LQ9NUG4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCM2LQ9NUG4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCM2LQ9NUG4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCM2LQ9NUG4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCM2LQ9NUG4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCM2LQ9NUG4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCM2LQ9NUG4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCM2LQ9NUG4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCM2LQ9NUG4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCM2LQ9NUG4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCM2LQ9NUG4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCM2LQ9NUG4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCM2LQ9NUG4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCM2LQ9NUG4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCM2LQ9NUG4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCM2LQ9NUG4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCM2LQ9NUG4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCM2LQ9NUG4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCM2LQ9NUG4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCM2LQ9NUG4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCM2LQ9NUG4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCM2LQ9NUG4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCM2LQ9NUG4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCM2LQ9NUG4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCM2LQ9NUG4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCM2LQ9NUG4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCM2LQ9NUG4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCM2LQ9NUG4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCM2LQ9NUG4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCM2LQ9NUG4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCM2LQ9NUG4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCM2LQ9NUG4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCM2LQ9NUG4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCM2LQ9NUG4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCM2LQ9NUG4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCM2LQ9NUG4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCM2LQ9NUG4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCM2LQ9NUG4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCM2LQ9NUG4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCM2LQ9NUG4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCM2LQ9NUG4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCM2LQ9NUG4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCM2LQ9NUG4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCM2LQ9NUG4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCM2LQ9NUG4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCM2LQ9NUG4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCM2LQ9NUG4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCM2LQ9NUG4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCM2LQ9NUG4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCM2LQ9NUG4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCM2LQ9NUG4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCM2LQ9NUG4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCM2LQ9NUG4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCM2LQ9NUG4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCM2LQ9NUG4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCM2LQ9NUG4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCM2LQ9NUG4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCM2LQ9NUG4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCM2LQ9NUG4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCM2LQ9NUG4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCM2LQ9NUG4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCM2LQ9NUG4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCM2LQ9NUG4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCM2LQ9NUG4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCM2LQ9NUG4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCM2LQ9NUG4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms