Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS91

RAD18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD18Q9NS91 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD18Q9NS91 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD18Q9NS91 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD18Q9NS91 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD18Q9NS91 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD18Q9NS91 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD18Q9NS91 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD18Q9NS91 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD18Q9NS91 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD18Q9NS91 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD18Q9NS91 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD18Q9NS91 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD18Q9NS91 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD18Q9NS91 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD18Q9NS91 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD18Q9NS91 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD18Q9NS91 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD18Q9NS91 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD18Q9NS91 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD18Q9NS91 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD18Q9NS91 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD18Q9NS91 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD18Q9NS91 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD18Q9NS91 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD18Q9NS91 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD18Q9NS91 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD18Q9NS91 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD18Q9NS91 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD18Q9NS91 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD18Q9NS91 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD18Q9NS91 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD18Q9NS91 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD18Q9NS91 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD18Q9NS91 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD18Q9NS91 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD18Q9NS91 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD18Q9NS91 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD18Q9NS91 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD18Q9NS91 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD18Q9NS91 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD18Q9NS91 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD18Q9NS91 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD18Q9NS91 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD18Q9NS91 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD18Q9NS91 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD18Q9NS91 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD18Q9NS91 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD18Q9NS91 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD18Q9NS91 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD18Q9NS91 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD18Q9NS91 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD18Q9NS91 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD18Q9NS91 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD18Q9NS91 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD18Q9NS91 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD18Q9NS91 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD18Q9NS91 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD18Q9NS91 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD18Q9NS91 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD18Q9NS91 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAD18Q9NS91 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAD18Q9NS91 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD18Q9NS91 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD18Q9NS91 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD18Q9NS91 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD18Q9NS91 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD18Q9NS91 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD18Q9NS91 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD18Q9NS91 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD18Q9NS91 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD18Q9NS91 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD18Q9NS91 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD18Q9NS91 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD18Q9NS91 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD18Q9NS91 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD18Q9NS91 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD18Q9NS91 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD18Q9NS91 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD18Q9NS91 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD18Q9NS91 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD18Q9NS91 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD18Q9NS91 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD18Q9NS91 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD18Q9NS91 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD18Q9NS91 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD18Q9NS91 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD18Q9NS91 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD18Q9NS91 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD18Q9NS91 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD18Q9NS91 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD18Q9NS91 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD18Q9NS91 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD18Q9NS91 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD18Q9NS91 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD18Q9NS91 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD18Q9NS91 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD18Q9NS91 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD18Q9NS91 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD18Q9NS91 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD18Q9NS91 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms