Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNIP2Q9NS61 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNIP2Q9NS61 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNIP2Q9NS61 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNIP2Q9NS61 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNIP2Q9NS61 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNIP2Q9NS61 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNIP2Q9NS61 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNIP2Q9NS61 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNIP2Q9NS61 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNIP2Q9NS61 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNIP2Q9NS61 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNIP2Q9NS61 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNIP2Q9NS61 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNIP2Q9NS61 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNIP2Q9NS61 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNIP2Q9NS61 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNIP2Q9NS61 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms