Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

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Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LTBP3Q9NS15 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LTBP3Q9NS15 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LTBP3Q9NS15 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LTBP3Q9NS15 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
LTBP3Q9NS15 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LTBP3Q9NS15 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LTBP3Q9NS15 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LTBP3Q9NS15 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LTBP3Q9NS15 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LTBP3Q9NS15 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LTBP3Q9NS15 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LTBP3Q9NS15 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LTBP3Q9NS15 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LTBP3Q9NS15 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LTBP3Q9NS15 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LTBP3Q9NS15 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LTBP3Q9NS15 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LTBP3Q9NS15 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LTBP3Q9NS15 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LTBP3Q9NS15 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LTBP3Q9NS15 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LTBP3Q9NS15 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LTBP3Q9NS15 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LTBP3Q9NS15 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
LTBP3Q9NS15 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LTBP3Q9NS15 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LTBP3Q9NS15 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LTBP3Q9NS15 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
LTBP3Q9NS15 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
LTBP3Q9NS15 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LTBP3Q9NS15 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LTBP3Q9NS15 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LTBP3Q9NS15 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LTBP3Q9NS15 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
LTBP3Q9NS15 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
LTBP3Q9NS15 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LTBP3Q9NS15 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
LTBP3Q9NS15 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LTBP3Q9NS15 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LTBP3Q9NS15 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LTBP3Q9NS15 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LTBP3Q9NS15 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC29■■■□□ 2.23
LTBP3Q9NS15 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
LTBP3Q9NS15 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LTBP3Q9NS15 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LTBP3Q9NS15 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LTBP3Q9NS15 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LTBP3Q9NS15 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LTBP3Q9NS15 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LTBP3Q9NS15 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LTBP3Q9NS15 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LTBP3Q9NS15 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LTBP3Q9NS15 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LTBP3Q9NS15 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LTBP3Q9NS15 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LTBP3Q9NS15 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LTBP3Q9NS15 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
LTBP3Q9NS15 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LTBP3Q9NS15 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LTBP3Q9NS15 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LTBP3Q9NS15 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LTBP3Q9NS15 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LTBP3Q9NS15 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LTBP3Q9NS15 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LTBP3Q9NS15 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LTBP3Q9NS15 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LTBP3Q9NS15 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LTBP3Q9NS15 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LTBP3Q9NS15 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
LTBP3Q9NS15 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LTBP3Q9NS15 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LTBP3Q9NS15 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
LTBP3Q9NS15 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
LTBP3Q9NS15 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
LTBP3Q9NS15 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LTBP3Q9NS15 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LTBP3Q9NS15 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LTBP3Q9NS15 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
LTBP3Q9NS15 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
LTBP3Q9NS15 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LTBP3Q9NS15 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
LTBP3Q9NS15 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
LTBP3Q9NS15 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LTBP3Q9NS15 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LTBP3Q9NS15 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
LTBP3Q9NS15 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LTBP3Q9NS15 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LTBP3Q9NS15 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LTBP3Q9NS15 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LTBP3Q9NS15 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
LTBP3Q9NS15 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LTBP3Q9NS15 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LTBP3Q9NS15 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LTBP3Q9NS15 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LTBP3Q9NS15 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LTBP3Q9NS15 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LTBP3Q9NS15 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LTBP3Q9NS15 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LTBP3Q9NS15 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
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