Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERINC1Q9NRX5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERINC1Q9NRX5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERINC1Q9NRX5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERINC1Q9NRX5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERINC1Q9NRX5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERINC1Q9NRX5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERINC1Q9NRX5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERINC1Q9NRX5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERINC1Q9NRX5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERINC1Q9NRX5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERINC1Q9NRX5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERINC1Q9NRX5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERINC1Q9NRX5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERINC1Q9NRX5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERINC1Q9NRX5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERINC1Q9NRX5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERINC1Q9NRX5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERINC1Q9NRX5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERINC1Q9NRX5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERINC1Q9NRX5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SERINC1Q9NRX5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERINC1Q9NRX5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERINC1Q9NRX5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERINC1Q9NRX5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERINC1Q9NRX5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SERINC1Q9NRX5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERINC1Q9NRX5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERINC1Q9NRX5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERINC1Q9NRX5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERINC1Q9NRX5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERINC1Q9NRX5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERINC1Q9NRX5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERINC1Q9NRX5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SERINC1Q9NRX5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERINC1Q9NRX5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERINC1Q9NRX5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERINC1Q9NRX5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERINC1Q9NRX5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SERINC1Q9NRX5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERINC1Q9NRX5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERINC1Q9NRX5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERINC1Q9NRX5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERINC1Q9NRX5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERINC1Q9NRX5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERINC1Q9NRX5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERINC1Q9NRX5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERINC1Q9NRX5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SERINC1Q9NRX5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERINC1Q9NRX5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERINC1Q9NRX5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERINC1Q9NRX5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SERINC1Q9NRX5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SERINC1Q9NRX5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SERINC1Q9NRX5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SERINC1Q9NRX5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SERINC1Q9NRX5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SERINC1Q9NRX5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SERINC1Q9NRX5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SERINC1Q9NRX5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SERINC1Q9NRX5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SERINC1Q9NRX5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SERINC1Q9NRX5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERINC1Q9NRX5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERINC1Q9NRX5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERINC1Q9NRX5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERINC1Q9NRX5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SERINC1Q9NRX5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERINC1Q9NRX5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SERINC1Q9NRX5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SERINC1Q9NRX5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SERINC1Q9NRX5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SERINC1Q9NRX5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SERINC1Q9NRX5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SERINC1Q9NRX5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SERINC1Q9NRX5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SERINC1Q9NRX5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SERINC1Q9NRX5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SERINC1Q9NRX5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SERINC1Q9NRX5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SERINC1Q9NRX5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SERINC1Q9NRX5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SERINC1Q9NRX5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SERINC1Q9NRX5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SERINC1Q9NRX5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SERINC1Q9NRX5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SERINC1Q9NRX5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SERINC1Q9NRX5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SERINC1Q9NRX5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SERINC1Q9NRX5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SERINC1Q9NRX5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SERINC1Q9NRX5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SERINC1Q9NRX5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SERINC1Q9NRX5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SERINC1Q9NRX5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SERINC1Q9NRX5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SERINC1Q9NRX5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SERINC1Q9NRX5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SERINC1Q9NRX5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SERINC1Q9NRX5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms