Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SH2B1Q9NRF2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SH2B1Q9NRF2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SH2B1Q9NRF2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SH2B1Q9NRF2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SH2B1Q9NRF2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SH2B1Q9NRF2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SH2B1Q9NRF2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SH2B1Q9NRF2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SH2B1Q9NRF2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SH2B1Q9NRF2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SH2B1Q9NRF2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SH2B1Q9NRF2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SH2B1Q9NRF2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SH2B1Q9NRF2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SH2B1Q9NRF2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SH2B1Q9NRF2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SH2B1Q9NRF2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SH2B1Q9NRF2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SH2B1Q9NRF2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SH2B1Q9NRF2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SH2B1Q9NRF2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SH2B1Q9NRF2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SH2B1Q9NRF2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SH2B1Q9NRF2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SH2B1Q9NRF2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SH2B1Q9NRF2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SH2B1Q9NRF2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SH2B1Q9NRF2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SH2B1Q9NRF2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SH2B1Q9NRF2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SH2B1Q9NRF2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SH2B1Q9NRF2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SH2B1Q9NRF2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SH2B1Q9NRF2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SH2B1Q9NRF2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SH2B1Q9NRF2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SH2B1Q9NRF2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SH2B1Q9NRF2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SH2B1Q9NRF2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SH2B1Q9NRF2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SH2B1Q9NRF2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SH2B1Q9NRF2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SH2B1Q9NRF2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SH2B1Q9NRF2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SH2B1Q9NRF2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SH2B1Q9NRF2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SH2B1Q9NRF2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SH2B1Q9NRF2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SH2B1Q9NRF2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SH2B1Q9NRF2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SH2B1Q9NRF2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SH2B1Q9NRF2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SH2B1Q9NRF2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SH2B1Q9NRF2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SH2B1Q9NRF2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SH2B1Q9NRF2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SH2B1Q9NRF2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
SH2B1Q9NRF2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SH2B1Q9NRF2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SH2B1Q9NRF2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SH2B1Q9NRF2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SH2B1Q9NRF2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SH2B1Q9NRF2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SH2B1Q9NRF2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SH2B1Q9NRF2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SH2B1Q9NRF2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SH2B1Q9NRF2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH2B1Q9NRF2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH2B1Q9NRF2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH2B1Q9NRF2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH2B1Q9NRF2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH2B1Q9NRF2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH2B1Q9NRF2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH2B1Q9NRF2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH2B1Q9NRF2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH2B1Q9NRF2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SH2B1Q9NRF2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SH2B1Q9NRF2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SH2B1Q9NRF2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SH2B1Q9NRF2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SH2B1Q9NRF2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH2B1Q9NRF2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH2B1Q9NRF2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH2B1Q9NRF2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH2B1Q9NRF2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH2B1Q9NRF2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH2B1Q9NRF2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH2B1Q9NRF2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH2B1Q9NRF2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SH2B1Q9NRF2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH2B1Q9NRF2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SH2B1Q9NRF2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SH2B1Q9NRF2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SH2B1Q9NRF2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SH2B1Q9NRF2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SH2B1Q9NRF2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SH2B1Q9NRF2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SH2B1Q9NRF2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SH2B1Q9NRF2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms